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公开(公告)号：CN112708635B
公开(公告)日：2023-02-21
申请号：CN202011620055.4
申请日：2020-12-30
申请人： 南通大学附属医院
IPC分类号： C12N15/85 , C12N15/65 , C12N15/12 , C12Q1/6804 , C12Q1/6834
摘要： 本发明提供一种转录因子CEBPB和TFCP2竞争结合CPEB1基因启动子区调节CPEB1基因表达的方法，包括如下步骤：S1、通过实验验证转录因子CEBPB可结合CPEB1基因启动子区，而当CPEB1基因启动子区高甲基化状态，转录因子CEBPB无法结合，影响CPEB1基因的染色质可及性，从而抑制CPEB1基因的表达；S2、通过实验验证CPEB1基因启动子区高甲基化状态时，转录因子TFCP2可结合CPEB1基因启动子区，从而阻止转录因子CEBPB的结合。本发明的实验结果表明CPEB1基因启动子区的高DNA甲基化状态可增加转录因子TFCP2的结合活性，使其启动子区不能结合CEBPB，同时证明转录因子TFCP2是一新的DNA甲基化识别因子。
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公开(公告)号：CN118050514A
公开(公告)日：2024-05-17
申请号：CN202410294612.X
申请日：2024-03-15
申请人： 南通大学附属医院
IPC分类号： G01N33/574
摘要： 本发明涉及生物医学技术领域，具体的，本申请提供了SAM作为生物标志物在制备早期筛查与诊断结直肠癌产品中的应用，本申请通过收集临床资料及血液样本进行酶联免疫吸附法（ELISA）检测血浆中S‑腺苷甲硫氨酸（SAM）的含量。发现结直肠癌患者血浆中SAM浓度显著高于正常对照人群。本研究通过检测外周血SAM水平，发现SAM可作为CRC的诊断生物标志物。通过ELISA方法在血清中即可检测，方便准确，成本低，是一种适合临床开展的实验诊断方法。
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公开(公告)号：CN112708635A
公开(公告)日：2021-04-27
申请号：CN202011620055.4
申请日：2020-12-30
申请人： 南通大学附属医院
IPC分类号： C12N15/85 , C12N15/65 , C12N15/12 , C12Q1/6804 , C12Q1/6834
摘要： 本发明提供一种转录因子CEBPB和TFCP2竞争结合CPEB1基因启动子区调节CPEB1基因表达的方法，包括如下步骤：S1、通过实验验证转录因子CEBPB可结合CPEB1基因启动子区，而当CPEB1基因启动子区高甲基化状态，转录因子CEBPB无法结合，影响CPEB1基因的染色质可及性，从而抑制CPEB1基因的表达；S2、通过实验验证CPEB1基因启动子区高甲基化状态时，转录因子TFCP2可结合CPEB1基因启动子区，从而阻止转录因子CEBPB的结合。本发明的实验结果表明CPEB1基因启动子区的高DNA甲基化状态可增加转录因子TFCP2的结合活性，使其启动子区不能结合CEBPB，同时证明转录因子TFCP2是一新的DNA甲基化识别因子。
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公开(公告)号：CN112481273A
公开(公告)日：2021-03-12
申请号：CN202011585665.5
申请日：2020-12-29
申请人： 南通大学附属医院
IPC分类号： C12N15/12 , C12Q1/6886
摘要： 本发明提供一种结直肠癌抑癌基因，为CPEB1基因。本发明还提供一种结直肠癌抑癌基因的启动子区高DNA甲基化的验证方法，通过DNA甲基化靶向测序技术检测甲基化程度、荧光定量PCR技术检测基因mRNA表达、Western印迹技术检测蛋白水平、流式细胞术检测细胞凋亡情况、CCK‑8实验和细胞克隆形成实验评估细胞增殖克隆能力、损伤修复实验评估细胞迁移能力、Transwell小室实验评估细胞侵袭能力、裸鼠成瘤实验模拟CPEB1基因在体内的致瘤能力等实验，证明CPEB1基因是一新的结直肠癌抑癌基因，且其启动子区存在高DNA甲基化位点，基因表达呈低表达模式。
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公开(公告)号：CN112481273B
公开(公告)日：2023-11-24
申请号：CN202011585665.5
申请日：2020-12-29
申请人： 南通大学附属医院
IPC分类号： C12N15/12 , C12Q1/6886
摘要： 本发明提供一种结直肠癌抑癌基因，为CPEB1基因。本发明还提供一种结直肠癌抑癌基因的启动子区高DNA甲基化的验证方法，通过DNA甲基化靶向测序技术检测甲基化程度、荧光定量PCR技术检测基因mRNA表达、Western印迹技术检测蛋白水平、流式细胞术检测细胞凋亡情况、CCK‑8实验和细胞克隆形成实验评估细胞增殖克隆能力、损伤修复实验评估细胞迁移能力、Transwell小室实验评估细胞侵袭能力、裸鼠成瘤实验模拟CPEB1基因在体内的致瘤能力等实验，证明CPEB1基因是一新的结直肠癌抑癌基因，且其启动子区存在高DNA甲基化位点，基因表达呈低表达模式。
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公开(公告)号：CN114561471A
公开(公告)日：2022-05-31
申请号：CN202210356663.1
申请日：2022-04-06
申请人： 南通大学附属医院
IPC分类号： C12Q1/6886 , C12Q1/6851 , G01N33/574
摘要： 本发明提供一种SDK1作为结直肠癌的早期转移预警标志物的应用。涉及生物医药技术领域，本申请选择III期结直肠癌患者癌和癌旁对照组织，进行全转录组mRNA内部m7G甲基化测序和转录组测序，分析CRC患者淋巴转移的差异m7G甲基化谱和差异转录谱，并结合高效液相色谱‑质谱联用（LC‑MS/MS）技术，发现了一种与CRC早期转移分子事件中发挥重要作用的新的黏附分子SDK1(sidekick cell adhesion molecule 1)基因。并开发了SDK1基因m7G的分子生物学检测方法—meRIP（抗m7G抗体RNA免疫共沉淀）‑PCR（聚合酶链反应），以用于结直肠癌早期转移的预警标志物检测。
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公开(公告)号：CN117987543A
公开(公告)日：2024-05-07
申请号：CN202311766617.X
申请日：2023-12-20
申请人： 南通大学附属医院
IPC分类号： C12Q1/6886
摘要： 本发明提供P2RX1、CBFA2T3和CERS4的多重甲基化反应体系用于胰腺导管腺癌早期筛查与诊断，涉及生物医学技术领域，其技术要点在于：CBFA2T3、P2RX1和CERS4中至少一种ctDNA甲基化作为生物标志物在制备早期筛查与诊断胰腺导管腺癌产品中的应用。本申请中所提供的多重QMSP反应体系较单一体系降低了样本量、时间和成本，提高了诊断效能。且联合诊断模型在PDAC的筛查和评估临床分期方面的特异性与敏感性均显著高于CA19‑9和单一模型。
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公开(公告)号：CN110438228B
公开(公告)日：2022-12-23
申请号：CN201910702472.4
申请日：2019-07-31
申请人： 南通大学附属医院
IPC分类号： C12Q1/6886 , C12N15/11 , G16H50/20 , G16B20/20
摘要： 本发明提供一种用于预测结直肠癌(CRC)风险的DNA甲基化标志物集，所述标志物集包括ESR1、ZNF132、ZNF229、ZNF542和ZNF677；本发明还提供一种用于测定DNA甲基化标志物集的试剂盒；本发明还提供一种DNA甲基化标志物集用于制备预测受试者中结直肠癌(CRC)风险的试剂盒的用途。本发明还提供一种获取DNA甲基化标志物集的方法，本发明还提供一种用于评估结直肠癌DNA甲基化标志物集诊断准确性的方法，本发明提出了预测结直肠癌(CRC)风险的DNA甲基化标志物集并构建了诊断模型(模型1、模型2和模型3)，可用于CRC筛查与早期诊断，并优于目前广泛使用的SEPT9方法；可推广应用于结直肠癌的诊断。
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公开(公告)号：CN110438228A
公开(公告)日：2019-11-12
申请号：CN201910702472.4
申请日：2019-07-31
申请人： 南通大学附属医院
IPC分类号： C12Q1/6886 , C12N15/11 , G16H50/20 , G16B20/20
摘要： 本发明提供一种用于预测结直肠癌(CRC)风险的DNA甲基化标志物集，所述标志物集包括ESR1、ZNF132、ZNF229、ZNF542和ZNF677；本发明还提供一种用于测定DNA甲基化标志物集的试剂盒；本发明还提供一种DNA甲基化标志物集用于制备预测受试者中结直肠癌(CRC)风险的试剂盒的用途。本发明还提供一种获取DNA甲基化标志物集的方法，本发明还提供一种用于评估结直肠癌DNA甲基化标志物集诊断准确性的方法，本发明提出了预测结直肠癌(CRC)风险的DNA甲基化标志物集并构建了诊断模型(模型1、模型2和模型3)，可用于CRC筛查与早期诊断，并优于目前广泛使用的SEPT9方法；可推广应用于结直肠癌的诊断。
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