公开(公告)号：CN114373502B

公开(公告)日：2022-12-06

申请号：CN202210015606.7

申请日：2022-01-07

Applicant: 吉林大学第一医院

Inventor： 付聪 ,  宿晓云 ,  易星丞 ,  邱悦 ,  赵天一

IPC: G16B5/00 ,  G16B20/30 ,  G16B40/00

Abstract: 本发明公开了一种基于甲基化的肿瘤数据分析系统，包括：数据采集模块，用于采集肿瘤原始数据；数据处理模块，与数据采集模块连接，用于对肿瘤原始数据进行预处理，获得目标肿瘤数据；模型构建模块，与数据处理模块连接，用于构建甲基化加权基因调控网络，识别甲基化加权基因调控网络的基因模块；数据分析模块，分别与数据处理模块和模型构建模块连接，用于基于基因模块和目标肿瘤数据进行分析，获得分析结果。本发明能够精确确定关键DNA甲基化位点，为肿瘤甲基化水平机制的研究提供新的理论支撑。

公开(公告)号：CN114373502A

公开(公告)日：2022-04-19

申请号：CN202210015606.7

申请日：2022-01-07

Applicant: 吉林大学第一医院

Inventor： 付聪 ,  宿晓云 ,  易星丞 ,  邱悦 ,  赵天一

IPC: G16B5/00 ,  G16B20/30 ,  G16B40/00

Abstract: 本发明公开了一种基于甲基化的肿瘤数据分析系统，包括：数据采集模块，用于采集肿瘤原始数据；数据处理模块，与数据采集模块连接，用于对肿瘤原始数据进行预处理，获得目标肿瘤数据；模型构建模块，与数据处理模块连接，用于构建甲基化加权基因调控网络，识别甲基化加权基因调控网络的基因模块；数据分析模块，分别与数据处理模块和模型构建模块连接，用于基于基因模块和目标肿瘤数据进行分析，获得分析结果。本发明能够精确确定关键DNA甲基化位点，为肿瘤甲基化水平机制的研究提供新的理论支撑。

公开(公告)号：CN116246713A

公开(公告)日：2023-06-09

申请号：CN202310296417.6

申请日：2023-03-24

Applicant: 吉林大学第一医院

Inventor： 易星丞 ,  戴云 ,  靳凤艳 ,  兰茂卓 ,  潘晓强 ,  孙月 ,  李佳佳 ,  张丽娟

IPC: G16B40/30 ,  G16B40/20 ,  G06F18/24 ,  G06F18/23 ,  G06F18/2135

Abstract: 本发明公开了一种基于基因调控网络的单细胞肿瘤微环境数据分析方法，包括以下步骤：获取若干个细胞的原始数据值，并进行预处理和特征基因识别；基于获得的特征基因之间的调控关系，构建Degree基因表征矩阵，并识别细胞亚群；对所述细胞亚群进行细胞熵的分析、差异Degree基因的识别以及基因功能富集的分析。本发明通过SCILE算法以每一基因在每一细胞中基因调控网络的重要程度评估细胞整体的干性熵值，相比于传统基于表达量的评估方法，本方法避免因高表达低调控基因对于细胞干性的影响。