公开(公告)号：CN110499380B

公开(公告)日：2023-05-26

申请号：CN201910949994.4

申请日：2019-10-08

Applicant: 哈尔滨工业大学(威海)

Inventor： 史宏伟 ,  郭长禄 ,  张治洲 ,  刘倩倩

IPC: C12Q1/689 ,  C12Q1/6851 ,  C12Q1/06 ,  C12N15/11 ,  C12R1/20

Abstract: 本发明提供了一种检测黄杆菌的引物对和检测方法，属于生物技术及海洋科学技术领域，所述引物对包括上游引物和下游引物，所述上游引物的核苷酸序列如SEQ ID No.1所示，所述下游引物的核苷酸序列如SEQ ID No.2所示。在本发明中，所述引物对根据SNP位点再结合扩展性SAP方法设计得到引物对，所述引物对对黄杆菌具有特异性，进一步利用本发明提供的检测方法能够定量检测样本中的黄杆菌。

公开(公告)号：CN108949901B

公开(公告)日：2022-07-15

申请号：CN201810929537.4

申请日：2018-08-15

Applicant: 哈尔滨工业大学(威海)

Inventor： 刘倩倩 ,  陈彬彬 ,  张治洲 ,  何宏魁 ,  曹润洁 ,  李安军

IPC: C12Q1/44 ,  C12Q1/04

Abstract: 本发明属于生物技术领域，涉及一种快速鉴定窖泥中甲烷囊菌(Methanoculleus)的酶切方法，该方法包含以下步骤：(1)将窖泥中含量最高的30个优势菌属与甲烷囊菌属的16S rDNA全长序列分别进行MAFFT比对，找出各属的代表性序列2‑4个；(2)各属代表性序列的酶切分析，从中找出来甲烷囊菌16S rDNA全长序列的特征性酶切方式3‑10种；(3)在全部30个优势菌属与甲烷囊菌属的16S rDNA全长序列中逐一验证上述3‑10种特征性酶切方式。(4)经过确认的特征性酶切方式再进行实验验证。(5)最终确认至少一种甲烷囊菌16S rDNA全长序列的特征性酶切方式用于窖泥厌氧培养过程中菌落的快速鉴定。本发明可达到从窖泥厌氧菌群中快速识别甲烷囊菌属细菌的目的，比起常规测序鉴定节省大量时间。

公开(公告)号：CN110499380A

公开(公告)日：2019-11-26

申请号：CN201910949994.4

申请日：2019-10-08

Applicant: 哈尔滨工业大学(威海)

Inventor： 史宏伟 ,  郭长禄 ,  张治洲 ,  刘倩倩

IPC: C12Q1/689 ,  C12Q1/6851 ,  C12Q1/06 ,  C12N15/11 ,  C12R1/20

Abstract: 本发明提供了一种检测黄杆菌的引物对和检测方法，属于生物技术及海洋科学技术领域，所述引物对包括上游引物和下游引物，所述上游引物的核苷酸序列如SEQ ID No.1所示，所述下游引物的核苷酸序列如SEQ ID No.2所示。在本发明中，所述引物对根据SNP位点再结合扩展性SAP方法设计得到引物对，所述引物对对黄杆菌具有特异性，进一步利用本发明提供的检测方法能够定量检测样本中的黄杆菌。

公开(公告)号：CN108949901A

公开(公告)日：2018-12-07

申请号：CN201810929537.4

申请日：2018-08-15

Applicant: 哈尔滨工业大学(威海)

Inventor： 刘倩倩 ,  陈彬彬 ,  张治洲 ,  何宏魁 ,  曹润洁 ,  李安军

IPC: C12Q1/44 ,  C12Q1/04

CPC classification number: C12Q1/44 ,  C12Q1/04

Abstract: 本发明属于生物技术领域，涉及一种快速鉴定窖泥中甲烷囊菌(Methanoculleus)的酶切方法，该方法包含以下步骤：(1)将窖泥中含量最高的30个优势菌属与甲烷囊菌属的16S rDNA全长序列分别进行MAFFT比对，找出各属的代表性序列2‑4个；(2)各属代表性序列的酶切分析，从中找出来甲烷囊菌16S rDNA全长序列的特征性酶切方式3‑10种；(3)在全部30个优势菌属与甲烷囊菌属的16S rDNA全长序列中逐一验证上述3‑10种特征性酶切方式。(4)经过确认的特征性酶切方式再进行实验验证。(5)最终确认至少一种甲烷囊菌16S rDNA全长序列的特征性酶切方式用于窖泥厌氧培养过程中菌落的快速鉴定。本发明可达到从窖泥厌氧菌群中快速识别甲烷囊菌属细菌的目的，比起常规测序鉴定节省大量时间。