公开(公告)号：CN117004699A

公开(公告)日：2023-11-07

申请号：CN202310990942.8

申请日：2023-08-08

申请人： 四川大学华西医院

发明人： 吉航 ,  刘翼 ,  肖安琪 ,  李悦 ,  胡韶山

IPC分类号： C12Q1/6869 ,  C12Q1/6874 ,  C12Q1/6886 ,  G16B20/30 ,  G16B40/00

摘要： 本发明涉及生物医学技术领域，且公开了IDH野生型胶质母细胞瘤患者的预后方法，包括以下步骤：S1,通过对原发IDH野生型胶质母细胞瘤肿瘤组织进行的RNA‑seq或基因芯片测序；S2，计算患者的COVPRIG评分。纳入计算的的基因包括：RIT2，OAS1，HOXA5，MLLT11，SLC1A2，FAM189A2，LOXL1，NCAPG，C21orf62，GOLGA8A，UBE2S，NRXN1。对于RNA‑seq测序的样本，将得到基因表达的Count值标准化为TPM值，然后进行对数转化，即log(TPM+1)，然后依次计算GG score和COVPRIGRNA‑seq评分，后者即为患者的最终得分。对于通过基因芯片测序的患者，将获得的基因表达量做对数转化后以此计算GG score和COVPRIGmicroarray评分。该方法通过对原发IDH野生型胶质母细胞瘤肿瘤组织进行上述特定基因(基因panel)的测序和计算COVPRIG评分，可以有效的评估基因表达量。