基于多组学联合分析筛选脊髓损伤关键基因、代谢物和通路的方法

    公开(公告)号:CN115938482A

    公开(公告)日:2023-04-07

    申请号:CN202211559886.4

    申请日:2022-12-06

    IPC分类号: G16B20/30 G16B20/20 G16H50/20

    摘要: 基于多组学联合分析筛选脊髓损伤关键基因、代谢物和通路的方法,步骤为:(1)建立脊髓损伤实验动物模型,并设定脊髓损伤组及假手术组,进行运动功能评分观察实验动物损伤侧运动功能情况;(2)提取各组损伤脊髓组织样本,用HE染色和Nissl染色进行组织学检测,用RNA‑seq技术进行转录组测序,用LC‑MS/MS技术进行代谢组测序;(3)应用生物信息学分析单个组学的生物学意义;(4)整合转录组数据和代谢组数据进行联合分析,发掘影响脊髓损伤病理生理机制关键基因、代谢物及通路,同时构建基因‑代谢物网络互作图。本发明揭示了影响脊髓损伤病理生理进程的分子机制及损伤微环境基因和代谢物关系,为脊髓损伤多组学联合分析及作用提供研究依据。