公开(公告)号：CN115148289B

公开(公告)日：2023-01-24

申请号：CN202211081173.1

申请日：2022-09-06

申请人： 安诺优达基因科技(北京)有限公司

发明人： 李志民 ,  杨伟飞 ,  王娟 ,  张雪梅 ,  李晓波 ,  涂成芳 ,  刘涛 ,  王众司

IPC分类号： G16B30/10 ,  G16B30/20 ,  G16B20/20

摘要： 本发明公开了一种同源四倍体基因组分型组装的方法和装置、构建染色体的方法和装置及其应用。该分型组装的方法包括：步骤1、将样本的测序数据集与近缘二倍体物种的分型后的参考基因组分别进行比对；根据比对结果鉴定基因组变异信息并分型，得到能分型的且与参考基因组相似的测序数据集I、能分型的且与参考基因组不相似的测序数据集II，以及无法分型的测序数据集III；步骤2、提取单碱基深度≥1/2平均深度的测序数据集IV；步骤3、将测序数据集I与测序数据集III组装；将测序数据集II与测序数据集III、测序数据集IV组装。本发明的方法和装置具有良好的分型组装效果，可以应用于高度同源的同源四倍体样本，而且花费较低，取样容易。

公开(公告)号：CN116168763A

公开(公告)日：2023-05-26

申请号：CN202211691347.6

申请日：2022-09-06

申请人： 安诺优达基因科技(北京)有限公司

发明人： 李志民 ,  杨伟飞 ,  王娟 ,  张雪梅 ,  李晓波 ,  涂成芳 ,  刘涛 ,  王众司

IPC分类号： G16B30/20 ,  G16B20/30 ,  G16B30/10

摘要： 本发明公开了一种同源四倍体基因组分型组装的方法和装置、构建染色体的方法和装置及其应用。该分型组装的方法包括：步骤1、将样本的测序数据集与近缘二倍体物种的分型后的参考基因组分别进行比对；根据比对结果鉴定基因组变异信息并分型，得到能分型的且与参考基因组相似的测序数据集I、能分型的且与参考基因组不相似的测序数据集II，以及无法分型的测序数据集III；步骤2、提取单碱基深度≥1/2平均深度的测序数据集IV；步骤3、将测序数据集I与测序数据集III组装；将测序数据集II与测序数据集III、测序数据集IV组装。本发明的方法和装置具有良好的分型组装效果，可以应用于高度同源的同源四倍体样本，而且花费较低，取样容易。

公开(公告)号：CN116168763B

公开(公告)日：2024-08-13

申请号：CN202211691347.6

申请日：2022-09-06

申请人： 安诺优达基因科技(北京)有限公司

发明人： 李志民 ,  杨伟飞 ,  王娟 ,  张雪梅 ,  李晓波 ,  涂成芳 ,  刘涛 ,  王众司

IPC分类号： G16B30/20 ,  G16B20/30 ,  G16B30/10

摘要： 本发明公开了一种构建染色体的方法和装置及其应用。该方法包括：将同源四倍体样本的四组基因组进行染色体构建，同源四倍体样本的四组基因组通过同源四倍体基因组的分型组装方法获得。本发明的方法和装置具有良好的分型组装效果，可以应用于高度同源的同源四倍体样本，而且花费较低，取样容易。

公开(公告)号：CN115148289A

公开(公告)日：2022-10-04

申请号：CN202211081173.1

申请日：2022-09-06

申请人： 安诺优达基因科技(北京)有限公司

发明人： 李志民 ,  杨伟飞 ,  王娟 ,  张雪梅 ,  李晓波 ,  涂成芳 ,  刘涛 ,  王众司

IPC分类号： G16B30/10 ,  G16B30/20 ,  G16B20/20

摘要： 本发明公开了一种同源四倍体基因组分型组装的方法和装置、构建染色体的方法和装置及其应用。该分型组装的方法包括：步骤1、将样本的测序数据集与近缘二倍体物种的分型后的参考基因组分别进行比对；根据比对结果鉴定基因组变异信息并分型，得到能分型的且与参考基因组相似的测序数据集I、能分型的且与参考基因组不相似的测序数据集II，以及无法分型的测序数据集III；步骤2、提取单碱基深度≥1/2平均深度的测序数据集IV；步骤3、将测序数据集I与测序数据集III组装；将测序数据集II与测序数据集III、测序数据集IV组装。本发明的方法和装置具有良好的分型组装效果，可以应用于高度同源的同源四倍体样本，而且花费较低，取样容易。