公开(公告)号：CN103966335B

公开(公告)日：2015-09-30

申请号：CN201410220172.X

申请日：2014-05-22

申请人： 山东农业大学

发明人： 邓志英 ,  田纪春 ,  陈芳 ,  李文静 ,  陈建省

IPC分类号： C12Q1/68

摘要： 本发明涉及一种利用SNP开发与SNP紧密连锁的SNP-SSR分子标记的方法，步骤如下：(1)根据待开发样品的已知SNP分子标记在遗传图谱上的位置，查找获得SNP标记延伸序列；(2)将SNP标记延伸序列在待开发样品的基因组测序数据库进行比对，选取序列片段；(3)以重复序列长度≥20bp，对完全型、不完全型、复合型三种SSR进行查找，获得SSR位点；(4)根据SSR位点的侧翼区域设计引物，经PCR扩增和测序，选取带型稳定清晰的，获得待验证分子标记；(5)利用待验证分子标记的引物，制得SNP-SSR分子标记。本发明所述方法能够快速大量的筛选与SNP紧密连锁的SNP-SSR分子标记。

公开(公告)号：CN103966335A

公开(公告)日：2014-08-06

申请号：CN201410220172.X

申请日：2014-05-22

申请人： 山东农业大学

发明人： 邓志英 ,  田纪春 ,  陈芳 ,  李文静 ,  陈建省

IPC分类号： C12Q1/68

CPC分类号： C12Q1/6895 ,  C12Q2600/156

摘要： 本发明涉及一种利用SNP开发与SNP紧密连锁的SNP-SSR分子标记的方法，步骤如下：(1)根据待开发样品的已知SNP分子标记在遗传图谱上的位置，查找获得SNP标记延伸序列；(2)将SNP标记延伸序列在待开发样品的基因组测序数据库进行比对，选取序列片段；(3)以重复序列长度≥20bp，对完全型、不完全型、复合型三种SSR进行查找，获得SSR位点；(4)根据SSR位点的侧翼区域设计引物，经PCR扩增和测序，选取带型稳定清晰的，获得待验证分子标记；(5)利用待验证分子标记的引物，制得SNP-SSR分子标记。本发明所述方法能够快速大量的筛选与SNP紧密连锁的SNP-SSR分子标记。

公开(公告)号：CN103966336B

公开(公告)日：2015-08-19

申请号：CN201410220173.4

申请日：2014-05-22

申请人： 山东农业大学

发明人： 邓志英 ,  田纪春 ,  陈芳 ,  李文静

IPC分类号： C12Q1/68 ,  C12N15/11

摘要： 本发明涉及与小麦5D染色体中SNP紧密连锁的SNP-SSR分子标记检测引物。分子标记Xtdc11的检测引物，分别为SEQ ID NO.1和SEQ ID NO.2所示的核苷酸序列。分子标记Xtdc31的检测引物，分别为SEQ ID NO.3和SEQ ID NO.4所示的核苷酸序列。分子标记Xtdc38的检测引物，分别为SEQ ID NO.5和SEQ ID NO.6所示的核苷酸序列。分子标记Xtdc44的检测引物，分别为SEQ ID NO.7和SEQ ID NO.8所示的核苷酸序列。本发明所述的与SNP紧密连锁的SNP-SSR分子标记为控制小麦重要性状基因的克隆提供了技术支持，提高了效率和质量。

公开(公告)号：CN103966336A

公开(公告)日：2014-08-06

申请号：CN201410220173.4

申请日：2014-05-22

申请人： 山东农业大学

发明人： 邓志英 ,  田纪春 ,  陈芳 ,  李文静

IPC分类号： C12Q1/68 ,  C12N15/11

CPC分类号： C12Q1/6895 ,  C12Q2600/13 ,  C12Q2600/156

摘要： 本发明涉及与小麦5D染色体中SNP紧密连锁的SNP-SSR分子标记检测引物。分子标记Xtdc11的检测引物，分别为SEQ ID NO.1和SEQ ID NO.2所示的核苷酸序列。分子标记Xtdc31的检测引物，分别为SEQ ID NO.3和SEQ ID NO.4所示的核苷酸序列。分子标记Xtdc38的检测引物，分别为SEQ ID NO.5和SEQ ID NO.6所示的核苷酸序列。分子标记Xtdc44的检测引物，分别为SEQ ID NO.7和SEQ ID NO.8所示的核苷酸序列。本发明所述的与SNP紧密连锁的SNP-SSR分子标记为控制小麦重要性状基因的克隆提供了技术支持，提高了效率和质量。