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公开(公告)号:CN110144407A
公开(公告)日:2019-08-20
申请号:CN201910399769.8
申请日:2019-05-14
申请人: 山东省农业科学院奶牛研究中心 , 山东奥克斯畜牧种业有限公司
IPC分类号: C12Q1/6888 , G01N33/573 , A01K67/02
摘要: 本公开属于家畜分子遗传生物技术领域,具体涉及一种基于FBXW11甲基化评价公牛精子活力的方法及应用。通过对公牛精液转录组进行高通量测序,本公开提供了FBXW11基因及11个影响公牛精子活力的甲基化位点,通过功能注释和数据整合分析开发出可用于评价公牛精子活力高低甲基化位点标记,建立几个关键甲基化位点的Bisulfite sequencing PCR检测方法,可用于评价种公牛精子活力。采用本公开技术方案,通过对基因DNA甲基化差异情况进行分析,筛选携带理想性状的个体或者是精液样本,选育出高繁殖力的公牛和具有高精子活力的精液,以提高种公牛和母牛的繁殖效率,达到增加经济效益的目的。
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公开(公告)号:CN110669838B
公开(公告)日:2022-07-05
申请号:CN201911006567.9
申请日:2019-10-22
申请人: 山东省农业科学院奶牛研究中心 , 山东奥克斯畜牧种业有限公司
IPC分类号: C12Q1/6883
摘要: 本公开属于奶牛乳腺炎标志物技术领域,具体涉及LGR4作为奶牛乳腺炎预防、诊断或治疗标志物的应用。本公开以半同胞健康和大肠杆菌乳腺炎奶牛为模型,对血液嗜中性粒细胞进行DNA甲基化和RNA‑seq测序,整合分析转录组和甲基化数据,筛选出奶牛嗜中性粒细胞中的关键基因LGR4。通过亚硫酸盐测序法、克隆测序法和实时荧光定量PCR实验等方法检测关键基因LGR4在血液嗜中性粒细胞中外显子区域的甲基化水平、可变剪接体和基因的表达情况,鉴定出调控LGR4基因可变剪接模式的DNA甲基化分子标记,揭示了基因外显子区DNA甲基化在奶牛乳腺炎中发挥调控作用的分子机制,为奶牛乳腺炎的抗病分子育种提供新证据。
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公开(公告)号:CN108823322B
公开(公告)日:2021-08-03
申请号:CN201810752412.9
申请日:2018-07-10
申请人: 山东省农业科学院奶牛研究中心 , 山东奥克斯畜牧种业有限公司
IPC分类号: C12Q1/6888 , C12N15/11
摘要: 本发明属于分子遗传生物技术领域,具体涉及一组用于筛选和/检测种公牛精子畸形率高低的SNP分子标记。PRKCB基因有12个完全连锁的SNP位点,单倍型分析获得2种单倍型,即H1(TCTGTTTCTAAC)、H2(CTCACCCTCTCA),总共有3种单倍型组合H1H1,H1H2,H2H2。与公牛精液品质进行关联分析表明,H1H2单倍型组合公牛冻精解冻后畸形率显著低于H1H1和H2H2单倍型组合的公牛(P
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公开(公告)号:CN108823322A
公开(公告)日:2018-11-16
申请号:CN201810752412.9
申请日:2018-07-10
申请人: 山东省农业科学院奶牛研究中心 , 山东奥克斯畜牧种业有限公司
IPC分类号: C12Q1/6888 , C12N15/11
摘要: 本发明属于分子遗传生物技术领域,具体涉及一组用于筛选和/检测种公牛精子畸形率高低的SNP分子标记。PRKCB基因有12个完全连锁的SNP位点,单倍型分析获得2种单倍型,即H1(TCTGTTTCTAAC)、H2(CTCACCCTCTCA),总共有3种单倍型组合H1H1,H1H2,H2H2。与公牛精液品质进行关联分析表明,H1H2单倍型组合公牛冻精解冻后畸形率显著低于H1H1和H2H2单倍型组合的公牛(P
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公开(公告)号:CN110669838A
公开(公告)日:2020-01-10
申请号:CN201911006567.9
申请日:2019-10-22
申请人: 山东省农业科学院奶牛研究中心 , 山东奥克斯畜牧种业有限公司
IPC分类号: C12Q1/6883
摘要: 本公开属于奶牛乳腺炎标志物技术领域,具体涉及LGR4作为奶牛乳腺炎预防、诊断或治疗标志物的应用。本公开以半同胞健康和大肠杆菌乳腺炎奶牛为模型,对血液嗜中性粒细胞进行DNA甲基化和RNA-seq测序,整合分析转录组和甲基化数据,筛选出奶牛嗜中性粒细胞中的关键基因LGR4。通过亚硫酸盐测序法、克隆测序法和实时荧光定量PCR实验等方法检测关键基因LGR4在血液嗜中性粒细胞中外显子区域的甲基化水平、可变剪接体和基因的表达情况,鉴定出调控LGR4基因可变剪接模式的DNA甲基化分子标记,揭示了基因外显子区DNA甲基化在奶牛乳腺炎中发挥调控作用的分子机制,为奶牛乳腺炎的抗病分子育种提供新证据。
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公开(公告)号:CN110144407B
公开(公告)日:2022-03-04
申请号:CN201910399769.8
申请日:2019-05-14
申请人: 山东省农业科学院奶牛研究中心 , 山东奥克斯畜牧种业有限公司
IPC分类号: C12Q1/6888 , G01N33/573 , A01K67/02
摘要: 本公开属于家畜分子遗传生物技术领域,具体涉及一种基于FBXW11甲基化评价公牛精子活力的方法及应用。通过对公牛精液转录组进行高通量测序,本公开提供了FBXW11基因及11个影响公牛精子活力的甲基化位点,通过功能注释和数据整合分析开发出可用于评价公牛精子活力高低甲基化位点标记,建立几个关键甲基化位点的Bisulfite sequencing PCR检测方法,可用于评价种公牛精子活力。采用本公开技术方案,通过对基因DNA甲基化差异情况进行分析,筛选携带理想性状的个体或者是精液样本,选育出高繁殖力的公牛和具有高精子活力的精液,以提高种公牛和母牛的繁殖效率,达到增加经济效益的目的。
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公开(公告)号:CN105925717A
公开(公告)日:2016-09-07
申请号:CN201610522855.X
申请日:2016-07-04
申请人: 山东省农业科学院奶牛研究中心
CPC分类号: C12Q1/6888 , C12Q2600/156
摘要: 本发明公开了一种检测A1和A2型荷斯坦牛的方法及其试剂盒,属于分子生物学检测技术领域,该方法以待测牛的DNA为模板设计专用引物,进行PCR扩增反应,扩增片段经EcoT22I酶切后进行琼脂糖凝胶电泳检测,凝胶检测DNA片段长度为434bp的牛为A1型牛;酶切后DNA片段为434bp、385bp和49bp为A1和A2杂合型牛;酶切后DNA片段为385bp和49bp为A2型牛。该检测方法操作便捷、成本低、准确性高,可以早期筛选A2型奶牛,减少养牛业的经济损失。
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公开(公告)号:CN105039567A
公开(公告)日:2015-11-11
申请号:CN201510526507.5
申请日:2015-08-25
申请人: 山东省农业科学院奶牛研究中心
CPC分类号: C12Q1/6888 , C12Q2600/124 , C12Q2600/156
摘要: 本发明涉及一组用于筛选和/检测种公牛射精量和鲜精活力高低的SNP分子标记。具体的,SNPs位点位于INCENP基因第19970位和34378位碱基,两个SNPs位点在种公牛群体中有多种基因型组合,通过提取种公牛冻精的基因组DNA,检测其INCENP基因的基因型组合,预测种公牛的射精量及鲜精活力。本发明成功筛选出种公牛INCENP基因的SNPs,首次阐明了种公牛INCENP基因单核苷酸多态性与种公牛射精量和鲜精活力的相关性,提供了用于检测种公牛射精量和鲜精活力的简便、高效方法,并开发出相应的检测试剂盒。该试剂盒具有成本低、可靠性稳定、效率高等优点,可以用于早期优质种公牛的筛选。
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公开(公告)号:CN104878005A
公开(公告)日:2015-09-02
申请号:CN201510341628.2
申请日:2015-06-18
申请人: 山东省农业科学院奶牛研究中心
摘要: 本发明公开一种影响种公牛繁殖性能的FAK基因分子标记及应用,分子标记为g.129462_129463insGAA。通过测定种公牛基因组DNA中FAK基因分子标记g.129462_129463insGAA,根据第129462和129463位点之间是否发生GAA三个碱基的插入突变,预测种公牛的繁殖性能高低,当种公牛FAK基因第129462和129463位点之间未发生GAA三碱基的插入时,种公牛繁殖性能最好。本发明首次阐明FAK基因功能性分子标记g.129462_129463insGAA与种公牛繁殖性能的相关性,提供预测种公牛繁殖性能的方法,还提供相关引物对和包含该引物对的试剂盒。
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公开(公告)号:CN104357579A
公开(公告)日:2015-02-18
申请号:CN201410748811.X
申请日:2014-12-09
申请人: 山东省农业科学院奶牛研究中心
CPC分类号: C12Q1/6888 , C12Q2600/124 , C12Q2600/156
摘要: 本发明公开了一种早期筛选优良精液品质种公牛的方法,步骤为,提取种公牛基因组DNA,测定公牛PRM2基因SNP位点g.478A>G,根据种公牛第478碱基的等位基因预测种公牛的精液品质:当种公牛PRM2基因SNP位点g.478A>G为GG基因型时,种公牛精液品质最好;当种公牛PRM2基因SNP位点g.478A>G为AA基因型时,种公牛精液品质最差。此外,PRM2基因SNP位点g.478A>G,使氨基酸序列发生变化,该位点氨基酸由精氨酸(R)变为甘氨酸(G)。本发明还提供了用于早期筛选优良精液品质种公牛的引物及其含有该引物的检测试剂盒。本发明首次阐明了公牛PRM2基因SNP位点与公牛精液品质的相关性,减少种公牛饲养的盲目性,节约成本,增加经济效益。
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