一种预测紫萍LncRNA以及功能注释的方法和应用

    公开(公告)号:CN118522344A

    公开(公告)日:2024-08-20

    申请号:CN202410749669.4

    申请日:2024-06-12

    摘要: 本发明属于生物信息学技术领域,具体涉及一种预测紫萍LncRNA以及功能注释的方法和应用。该方法利用三个适用于植物转录本编码能力预测效果极佳且对植物具有较强针对性的预测鉴定软件(RNAplonc、PINC、LncFinder)以及进行蛋白数据库比对的Trinotate软件进行紫萍LncRNA鉴定以及功能注释。本发明的LncRNA鉴定方法准确率高达到97%,具有高度的可靠性以及准确性,能够更准确更全面的鉴定出可能参与紫萍生长发育的LncRNA基因。此外,在靶基因的预测时,本发明对miRNA前体和非前体部分均进行了预测,更有助于揭示紫萍在硫胁迫下的LncRNA作用及其分子机理。

    一种提高紫萍原花青素含量的方法

    公开(公告)号:CN117016387A

    公开(公告)日:2023-11-10

    申请号:CN202310597544.X

    申请日:2023-05-25

    摘要: 本发明属于天然物质合成技术领域,具体涉及一种提高紫萍原花青素含量的方法。为促进紫萍在生态工程中的应用,本发明公开了一种提高紫萍原花青素含量的方法,通过利用含糖培养基培养紫萍,或利用含激素培养基培养紫萍,或利用不同波长的光照培养紫萍,或利用缺氮和/或缺磷培养基培养紫萍的方式来提高紫萍的原花青素含量,还可以通过基因工程手段提高4CL1、F3'H1、F3'H3、F3'H4、ANS1、PAL1、F3'H2、ANR3和F3H这些基因的表达量来提高紫萍的原花青素含量。本发明方法有助于开发和利用紫萍生产原花青素,使紫萍变废为宝,也为环境因子调控紫萍原花青素生物合成的分子机制提供了理论依据。