公开(公告)号：CN112513292A

公开(公告)日：2021-03-16

申请号：CN201880096241.7

申请日：2018-08-27

申请人： 深圳华大生命科学研究院

发明人： 张海萍 ,  杨林 ,  黄国栋 ,  曾鹏 ,  高雅 ,  陈芳

IPC分类号： C12Q1/6869

摘要： 一种基于高通量测序检测同源序列的方法和装置，所述方法包括：获取样本的一对同源序列的特异性扩增产物的高通量测序结果，特异性扩增产物包含至少一个用于区分同源序列的序列特异性位点；将高通量测序结果与参考序列进行比对，并根据序列特异性位点将高通量测序结果区分为两组，每组归属于一个同源序列；将每组归属于一个同源序列的高通量测序结果分别与去除了另一个同源序列的参考序列进行比对；和统计比对到去除了另一个同源序列的参考序列的reads数目，根据reads数确定样本的同源序列信息。本发明能够解决同源序列来源的精确定位问题，实现准确检测突变的目的。

公开(公告)号：CN110462064A

公开(公告)日：2019-11-15

申请号：CN201880017694.6

申请日：2018-04-16

申请人： 深圳华大生命科学研究院

发明人： 卢森 ,  高雅 ,  姬敬开 ,  麻锦敏 ,  赵佳 ,  黄国栋 ,  陈芳 ,  蒋慧

IPC分类号： C12Q1/6869 ,  C12Q1/04 ,  C12Q1/70

摘要： 本发明提供了基于外泌体核酸进行微生物检测的方法及其应用。所述方法包括：(a)从待测样品中分离获得外泌体核酸，所述待测样品来自于第一物种；(b)对所述外泌体核酸进行测序，获得测序结果；(c)从所述测序结果中排除对应于所述第一物种的核酸序列，从而获得经去除处理的序列数据；和(d)将所述经去除处理的序列数据与微生物数据库的核酸序列进行比对，获得所述样品中的微生物检测结果。

公开(公告)号：CN110603328B

公开(公告)日：2024-01-12

申请号：CN201780090496.8

申请日：2017-06-20

申请人： 深圳华大生命科学研究院

发明人： 杨林 ,  高雅 ,  张艳艳 ,  张海萍 ,  黄国栋 ,  陈芳 ,  徐惠欣 ,  蒋慧 ,  徐讯

IPC分类号： C12N15/11 ,  C12Q1/6806 ,  C12Q1/6851

摘要： 提供了定量PCR扩增引物对，其包括：第一引物和第二引物，其中，所述第一引物包含第一特异性序列和第一随机序列，所述第一特异性序列位于所述第一引物的3’端，所述第一随机序列位于所述第一引物的5’端，所述第二引物包含第二特异性序列和第二随机序列，所述第二特异性序列位于所述第二引物的3’端，所述第二随机序列位于所述第二引物的5’端，并且，第一特异性序列和第二特异性序列分别为针对靶序列的上游引物和下游引物，第一随机序列和第二随机序列反向互补，所述第一引物的5’末端碱基和所述第二引物的5’末端碱基均连接有荧光基团，且距离所述第一引物的5’末端碱基和所述第二引物的5’末端碱基特定长度的碱基均连接有淬灭基团。

公开(公告)号：CN110603328A

公开(公告)日：2019-12-20

申请号：CN201780090496.8

申请日：2017-06-20

申请人： 深圳华大生命科学研究院

发明人： 杨林 ,  高雅 ,  张艳艳 ,  张海萍 ,  黄国栋 ,  陈芳 ,  徐惠欣 ,  蒋慧 ,  徐讯

IPC分类号： C12N15/11 ,  C12Q1/6806 ,  C12Q1/6851

摘要： 提供了定量PCR扩增引物对，其包括：第一引物和第二引物，其中，所述第一引物包含第一特异性序列和第一随机序列，所述第一特异性序列位于所述第一引物的3’端，所述第一随机序列位于所述第一引物的5’端，所述第二引物包含第二特异性序列和第二随机序列，所述第二特异性序列位于所述第二引物的3’端，所述第二随机序列位于所述第二引物的5’端，并且，第一特异性序列和第二特异性序列分别为针对靶序列的上游引物和下游引物，第一随机序列和第二随机序列反向互补，所述第一引物的5’末端碱基和所述第二引物的5’末端碱基均连接有荧光基团，且距离所述第一引物的5’末端碱基和所述第二引物的5’末端碱基特定长度的碱基均连接有淬灭基团。

公开(公告)号：CN112513292B

公开(公告)日：2023-12-26

申请号：CN201880096241.7

申请日：2018-08-27

申请人： 深圳华大生命科学研究院

发明人： 张海萍 ,  杨林 ,  黄国栋 ,  曾鹏 ,  高雅 ,  陈芳

IPC分类号： C12Q1/6869

摘要： 一种基于高通量测序检测同源序列的方法和装置，所述方法包括：获取样本的一对同源序列的特异性扩增产物的高通量测序结果，特异性扩增产物包含至少一个用于区分同源序列的序列特异性位点；将高通量测序结果与参考序列进行比对，并根据序列特异性位点将高通量测序结果区分为两组，每组归属于一个同源序列；将每组归属于一个同源序列的高通量测序结果分别与去除了另一个同源序列的参考序列进行比对；和统计比对到去除了另一个同源序列的参考序列的reads数目，根据reads数确定样本的同源序列信息。本发明能够解决同源序列来源的精确定位问题，实现准确检测突变的目的。