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公开(公告)号:CN117551774B
公开(公告)日:2025-03-21
申请号:CN202311487571.8
申请日:2023-11-09
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6858 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种绵羊MAST4基因插入/缺失多态性的检测方法及其应用。以澳洲白绵羊、贵乾半细毛羊全基因组DNA为模板,通过PCR扩增MAST4基因部分片段,再进行琼脂糖凝胶电泳,根据电泳结果鉴定MAST4基因上29‑bp插入/缺失多态性位点的基因型。关联分析结果表明,MAST4基因29‑bp插入/缺失多态性位点的不同基因型与澳洲白绵羊、贵乾半细毛羊的产羔数性状差异均显著相关,并存在作为绵羊繁殖性状标记辅助选择的DNA标记,可用于快速建立优良绵羊遗传资源群体。
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公开(公告)号:CN110468218B
公开(公告)日:2022-09-02
申请号:CN201910878058.9
申请日:2019-09-17
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种山羊IGF2BP1基因插入/缺失标记的检测方法:以待测山羊全基因组DNA为模板,通过PCR扩增山羊IGF2BP1基因部分片段,再进行琼脂糖凝胶电泳,根据电泳结果鉴定山羊IGF2BP1基因15‑bp插入/缺失多态性位点和5‑bp插入/缺失多态性位点的基因型。所述山羊IGF2BP1基因的15‑bp和5‑bp插入/缺失多态性位点的不同基因型及两个位点的组合基因型与陕北白绒山羊的产羔数性状存在显著相关关系,可以作为提高山羊产羔数性状的DNA标记。本发明提供的检测山羊IGF2BP1基因插入/缺失标记的方法,可应用于山羊分子标记辅助选择育种中,加快建立优良山羊遗传资源群体。
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公开(公告)号:CN114703293A
公开(公告)日:2022-07-05
申请号:CN202210283316.0
申请日:2022-03-22
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6858 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种牛CRY1基因的InDel标记在繁殖性状早期选择中的应用。以待测奶牛全基因组DNA为模板,通过PCR扩增、琼脂糖凝胶电泳,鉴定CRY1基因NC_037332.1:g.70335656‑70335661位InDel位点的基因型。根据CRY1基因InDel位点的不同基因型与卵巢相关性状的关联分析结果,确定了CRY1基因InDel位点的基因型可作为提高奶牛繁殖力的DNA标记。本发明通过快速、精准的检测与繁殖力密切相关的InDel标记,可快速建立奶牛优势遗传资源群体,从而加快奶牛繁殖性状的标记辅助选择育种进程。
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公开(公告)号:CN110172516B
公开(公告)日:2022-05-17
申请号:CN201910218571.5
申请日:2019-03-21
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6869
Abstract: 本发明公开了一种检测黄牛lncFAM200B基因5'侧翼区单核苷酸多态性的方法及其应用,以中国地方黄牛全基因组DNA为模板,PCR扩增黄牛lncFAM200B基因5'侧翼区序列,再对PCR扩增产物进行琼脂糖凝胶电泳和DNA测序;根据测序结果鉴定黄牛lncFAM200B基因5'侧翼区的2个单核苷酸变异;关联分析发现lncFAM200B基因5'侧翼区的这2个单核苷酸位点对生长性状具有重要调控,可作为分子标记。本发明提供的检测方法为建立lncFAM200B基因SNP与生长性状关系提供简单、快速的途径,检测结果可用于生长性状的标记辅助选择,加快建立遗传资源优良的黄牛种群。
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公开(公告)号:CN109880890B
公开(公告)日:2022-04-29
申请号:CN201910284640.2
申请日:2019-04-10
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6858 , C12Q1/6888
Abstract: 本发明公开了一种山羊HIAT1基因插入/缺失多态性的检测方法及其应用。以待测山羊全基因组DNA为模板,通过PCR扩增山羊HIAT1基因部分片段,再进行琼脂糖凝胶电泳,根据电泳结果鉴定山羊HIAT1基因NC_030810.1:g.7695‑7696位15‑bp插入/缺失多态性位点的基因型。相关分析结果发现,山羊HIAT1基因15‑bp插入/缺失多态性的不同基因型与陕北白绒山羊的生长性状存在显著相关关系,可作为提高山羊生长性状的DNA标记。本发明提供的检测山羊HIAT1基因插入/缺失多态性的方法,可应用于山羊分子标记辅助选择育种中,加快建立优良生长性状的山羊遗传资源群体。
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公开(公告)号:CN112980969A
公开(公告)日:2021-06-18
申请号:CN202110374309.7
申请日:2021-04-07
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6858 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种山羊CMTM2基因CNV标记的检测方法与应用:以山羊基因组DNA为模板,以引物对P1和P2为引物,通过实时荧光定量PCR分别扩增山羊CMTM2基因CNV区域和内参基因MC1R的部分片段,根据2×2‑ΔΔCt将定量结果分为插入型、缺失型和正常型,从而鉴定山羊CMTM2基因候选区域Chr18:35601201bp‑35603200bp的CNV类型。根据CMTM2基因的CNV类型与山羊生长性状的关联分析结果,本发明可在DNA水平上检测与山羊生长性状密切相关的CNV标记,从而通过山羊生长性状的标记辅助选择,快速建立遗传资源优良的山羊种群。
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公开(公告)号:CN112941202A
公开(公告)日:2021-06-11
申请号:CN202110304062.1
申请日:2021-03-22
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6858 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种牛SEPT7基因插入/缺失突变的检测方法及其应用。以牛全基因组DNA为模板,通过PCR扩增牛SEPT7基因部分片段,应用琼脂糖凝胶电泳鉴定个体SEPT7基因9‑bp插入突变的基因型。根据性状关联分析结果,SEPT7基因9‑bp插入突变位点的基因型与母牛的繁殖性状显著相关。因此,SEPT7基因9‑bp插入突变位点可用于母牛繁殖性状的早期标记辅助选择,以加快建立遗传资源优良的牛群体。
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公开(公告)号:CN108410997A
公开(公告)日:2018-08-17
申请号:CN201810188401.2
申请日:2018-03-07
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种公猪StAR基因5-bp重复缺失多态性的检测方法及其应用。该方法以待测公猪全基因组DNA为模板,通过PCR技术扩增StAR基因片段,随后进行琼脂糖凝胶电泳,根据电泳结果鉴定StAR基因在NC_010457.5:g.5524-5528位点存在5-bp重复缺失多态性。StAR基因5-bp重复缺失多态性不同基因型分别与15日龄和40日龄大白猪公猪的睾丸长轴长、睾丸短轴长和睾丸重等繁殖性状之间显著相关。本发明提供的检测公猪StAR基因插入/缺失的方法,可在公猪繁殖性状的标记辅助选择育种中应用,有利于快速建立繁殖性能优良的公猪遗传资源群体。
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公开(公告)号:CN102808018A
公开(公告)日:2012-12-05
申请号:CN201210153944.3
申请日:2012-05-17
Applicant: 西北农林科技大学
Abstract: 本发明公开了一种奶山羊PITX2基因单核苷酸多态性的检测方法,该方法以奶山羊基因组DNA或包含奶山羊PITX2基因的DNA序列为模板,利用PCR引物对P为引物,扩增奶山羊PITX2基因;通过限制性内切酶RsaI对其进行酶切,再根据琼脂糖凝胶电泳对酶切产物进行片段大小分离,利用凝胶成像系统分析其片段大小,从而确定奶山羊PITX2基因第543位的SNP。该SNP位点的TT基因型和TC基因型可作为显著提高奶山羊乳脂含量,而同时又显著降低乳糖含量、乳浓度的有效DNA标记。
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公开(公告)号:CN102260734A
公开(公告)日:2011-11-30
申请号:CN201110062692.9
申请日:2011-03-18
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/68
Abstract: 本发明公开了一种快速检测山羊同源异型框6(six6)基因单核苷酸多态性(SNP)的方法,以包含Six6基因的待测山羊全基因组DNA为模板,以引物对P为引物,PCR扩增山羊Six6基因;用限制性内切酶PstI消化PCR产物后,再进行琼脂糖凝胶电泳;根据电泳结果鉴定山羊Six6基因第232位的基因型(以序列Accession No.NM_001104993.1为参考);在动物生产实践中,由于Six6基因单核苷酸变异或SNP对形成胚胎、调控生长激素和促进垂体分泌激素等具有重要的作用,故将该位点不同基因型与生长发育性状数据进行关联分析。结果发现:CT基因型个体的管围显著大于CC基因型个体(P=0.047),说明CT基因型可以作为一个提高山羊管围的分子遗传标记。故本发明提供的快速检测Six6基因SNP的检测方法,在中国山羊生长性状的标记辅助选择(MAS)育种中,有利于快速建立遗传资源优良的山羊种群。
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