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公开(公告)号:CN117625828A
公开(公告)日:2024-03-01
申请号:CN202311528223.0
申请日:2023-11-16
申请人: 青岛农业大学
IPC分类号: C12Q1/6895 , G16B20/20 , G16B30/10 , C12Q1/6858 , C12N15/11 , C12R1/645
摘要: 本发明公开了一种基于全基因组重测序和KASP技术开发的灰树花标记及其应用。本发明对60株灰树花菌株进行全基因组重测序,获得原始SNP变异集合,筛选出1706个高质量位点,对SNP位点进行引物设计,其中1473个成功设计为KASP标记,利用基因分型实验,对分布在外显子区域的722个SNP标记筛选获得50个优质SNP标记集合,根据指纹图谱构建原则,进行鉴定效率作图,最终筛选获得12个核心SNP标记。本发明为灰树花生物学研究提供了一套可信、便于后期利用的SNP标记,可用于灰树花SNP检测试剂盒开发、遗传多样性分析、品种鉴定、DNA指纹图谱构建、种质资源和遗传群体基因分型及分子标记辅助选择育种等领域。