一种基于全基因组重测序和KASP技术开发的灰树花标记及其应用

    公开(公告)号:CN117625828A

    公开(公告)日:2024-03-01

    申请号:CN202311528223.0

    申请日:2023-11-16

    摘要: 本发明公开了一种基于全基因组重测序和KASP技术开发的灰树花标记及其应用。本发明对60株灰树花菌株进行全基因组重测序,获得原始SNP变异集合,筛选出1706个高质量位点,对SNP位点进行引物设计,其中1473个成功设计为KASP标记,利用基因分型实验,对分布在外显子区域的722个SNP标记筛选获得50个优质SNP标记集合,根据指纹图谱构建原则,进行鉴定效率作图,最终筛选获得12个核心SNP标记。本发明为灰树花生物学研究提供了一套可信、便于后期利用的SNP标记,可用于灰树花SNP检测试剂盒开发、遗传多样性分析、品种鉴定、DNA指纹图谱构建、种质资源和遗传群体基因分型及分子标记辅助选择育种等领域。