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    Viroid PSTVd ​​and TCDVd simultaneous detection method of
    1.
    发明专利
    Viroid PSTVd ​​and TCDVd simultaneous detection method of 有权

    公开(公告)号：JP5278919B2

    公开(公告)日：2013-09-04

    申请号：JP2010546754

    申请日：2010-05-26

    Applicant: 独立行政法人農業・食品産業技術総合研究機構

    Inventor： 陽介 松下 ,  新哉 津田

    IPC: C12Q1/68 ,  C12N15/09

    CPC classification number: C12Q1/6895 ,  C12Q1/701 ,  C12Q2600/16

    Abstract: The present invention relates to a method for detecting viroids, comprising: carrying out nucleic acid amplification reaction using RNA from a test plant sample as a template and a primer set comprising (i) a reverse primer of a sequence of 16 to 30 nucleotides in length within the sequence complement of the nucleotide sequence ranging from nucleotide positions 18 to 114 of a DNA sequence corresponding to the PSTVd genome (PSTVd genome-corresponding sequence); (ii) one or more forward primers for detection of PSTVd of 16 to 30 nucleotides in length, which are designed on the genome-corresponding sequence to locate the 3' end within the region ranging from nucleotide positions 127 to 147 in the PSTVd genome-corresponding sequence; and (iii) one or more forward primers for detection of TCDVd of 16 to 30 nucleotides in length, which are designed on the genome-corresponding sequence to locate the 3' end within the region ranging from nucleotide positions 210 to 224 of the PSTVd genome-corresponding sequence; and determining the presence or absence of nucleic acid amplification by the reverse primer and the forward primer for detection of PSTVd and of nucleic acid amplification by the reverse primer and the forward primer for detection of TCDVd to detect viroid PSTVd and TCDVd in the test plant distinguishing between them.

    ウイロイドＰＳＴＶｄ及びＴＣＤＶｄの同時検出方法
    2.
    发明专利
    ウイロイドＰＳＴＶｄ及びＴＣＤＶｄの同時検出方法 有权

    公开(公告)号：JPWO2010140518A1

    公开(公告)日：2012-11-15

    申请号：JP2010546754

    申请日：2010-05-26

    Applicant: 独立行政法人農業・食品産業技術総合研究機構

    Inventor： 陽介 松下 ,  陽介 松下 ,  新哉 津田 ,  新哉 津田

    IPC: C12Q1/68

    CPC classification number: C12Q1/6895 ,  C12Q1/701 ,  C12Q2600/16

    Abstract: 被験植物試料由来のRNAを鋳型として、(i) PSTVdゲノムに対応するDNA塩基配列(PSTVdゲノム対応配列)の塩基位置18番目から114番目の塩基配列に対する相補配列中の16〜30塩基長の配列からなるリバースプライマーと、(ii) そのPSTVdゲノム対応配列の塩基位置127番目から147番目の領域内に3'末端が位置するように当該ゲノム対応配列上に設計した16〜30塩基長の1種以上のPSTVd検出用フォワードプライマーと、(iii) そのPSTVdゲノム対応配列の塩基位置210番目から224番目の領域内に3'末端が位置するように当該ゲノム対応配列上に設計した16〜30塩基長の1種以上のTCDVd検出用フォワードプライマーとを含むプライマーセットを用いた核酸増幅を行い、前記リバースプライマーとPSTVd検出用フォワードプライマーによる核酸増幅及び前記リバースプライマーとTCDVd検出用フォワードプライマーによる核酸増幅の有無を判定することにより、被験植物中のウイロイドPSTVd及びTCDVdを区別して検出することを含む、ウイロイドの検出方法に関する。

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