公开(公告)号：US08618260B2

公开(公告)日：2013-12-31

申请号：US12310852

申请日：2007-09-08

申请人： Peter Hornbeck ,  Albrecht Moritz ,  John Rush ,  Steven Gygi

发明人： Peter Hornbeck ,  Albrecht Moritz ,  John Rush ,  Steven Gygi

IPC分类号： C07K16/00

CPC分类号： G01N33/6842 ,  C07K16/44 ,  G01N2440/14

摘要： The invention discloses 155 novel phosphorylation sites identified in carcinoma and leukemia, peptides (including AQUA peptides) comprising a phosphorylation site of the invention, antibodies specifically bind to a novel phosphorylation site of the invention, and diagnostic and therapeutic uses of the above.

公开(公告)号：US20130004963A1

公开(公告)日：2013-01-03

申请号：US12310852

申请日：2007-09-08

申请人： Peter Hornbeck ,  Judit Villen ,  Albrecht Moritz ,  John Rush ,  Steven Gygi ,  Sean Beausoleil ,  Scott Gerber

发明人： Peter Hornbeck ,  Judit Villen ,  Albrecht Moritz ,  John Rush ,  Steven Gygi ,  Sean Beausoleil ,  Scott Gerber

IPC分类号： G01N33/566 ,  C07K16/18 ,  G01N33/573

CPC分类号： G01N33/6842 ,  C07K16/44 ,  G01N2440/14

摘要： The invention discloses 155 novel phosphorylation sites identified in carcinoma and leukemia, peptides (including AQUA peptides) comprising a phosphorylation site of the invention, antibodies specifically bind to a novel phosphorylation site of the invention, and diagnostic and therapeutic uses of the above.

摘要翻译： 本发明公开了在癌和白血病中鉴定的155个新的磷酸化位点，包含本发明的磷酸化位点的肽（包括AQUA肽），特异性结合本发明的新的磷酸化位点的抗体，以及上述的诊断和治疗用途。

公开(公告)号：US09085609B2

公开(公告)日：2015-07-21

申请号：US11484485

申请日：2006-07-11

申请人： Michael J. Comb ,  Peter Hornbeck ,  Patrick Li

发明人： Michael J. Comb ,  Yi Tan ,  Peter Hornbeck

IPC分类号： C07K16/00 ,  C07K16/18

CPC分类号： C07K16/18 ,  C07K16/00 ,  C07K16/44 ,  C07K2317/20

摘要： A method is provided for producing motif-specific, context-independent antibodies that recognize a plurality of peptides or proteins within a genome that contain the same post-translationally modified motif. The method includes the step of immunizing a host with a degenerate peptide library antigen featuring (i) a fixed target motif containing one or more invariant amino acids including at least one modified amino acid, and (ii) a plurality of degenerate amino acids flanking the motif. Motif-specific, context-independent antibodies produced by the disclosed method are also provided. The method encompasses motifs consisting of a single modified amino acid, as well as short motifs comprising multiple invariant amino acids including one or more modified amino acids, such as all or part of kinase consensus substrate motifs, protein-protein binding motifs, or other cell signaling motifs. Methods of using the antibodies, e.g. for genome-wide profiling, are also provided.

摘要翻译： 提供了一种用于产生基序特异性，背景无关抗体的方法，其识别基因组内含有相同翻译后修饰基序的多个肽或蛋白质。 该方法包括用简并肽文库抗原免疫宿主的步骤，其特征在于（i）含有一个或多个包含至少一个修饰的氨基酸的不变氨基酸的固定靶基序，和（ii）多个位于 主题。 还提供了通过公开的方法产生的基于特异性的，与环境无关的抗体。 该方法包括由单个修饰的氨基酸组成的基序，以及包含多个不变氨基酸的短基序，包括一个或多个修饰的氨基酸，例如全部或部分激酶共有底物基序，蛋白质 - 蛋白质结合基序或其他细胞 信号图案。 使用抗体的方法，例如 也提供了全基因组图谱。

公开(公告)号：US20070026461A1

公开(公告)日：2007-02-01

申请号：US11484485

申请日：2006-07-11

申请人： Michael Comb ,  Yi Tan ,  Patrick Li ,  Peter Hornbeck

发明人： Michael Comb ,  Yi Tan ,  Patrick Li ,  Peter Hornbeck

IPC分类号： C40B30/06 ,  C40B50/06 ,  C40B40/10

CPC分类号： C07K16/18 ,  C07K16/00 ,  C07K16/44 ,  C07K2317/20

摘要： A method is provided for producing motif-specific, context-independent antibodies that recognize a plurality of peptides or proteins within a genome that contain the same post-translationally modified motif. The method includes the step of immunizing a host with a degenerate peptide library antigen featuring (i) a fixed target motif containing one or more invariant amino acids including at least one modified amino acid, and (ii) a plurality of degenerate amino acids flanking the motif. Motif-specific, context-independent antibodies produced by the disclosed method are also provided. The method encompasses motifs consisting of a single modified amino acid, as well as short motifs comprising multiple invariant amino acids including one or more modified amino acids, such as all or part of kinase consensus substrate motifs, protein-protein binding motifs, or other cell signaling motifs. Methods of using the antibodies, e.g. for genome-wide profiling, are also provided.

摘要翻译： 提供了一种用于产生基序特异性，背景无关抗体的方法，其识别基因组内含有相同翻译后修饰基序的多个肽或蛋白质。 该方法包括用简并肽文库抗原免疫宿主的步骤，其特征在于（i）含有一个或多个包含至少一个修饰的氨基酸的不变氨基酸的固定靶基序，和（ii）多个位于 主题。 还提供了通过公开的方法产生的基于特异性的，与环境无关的抗体。 该方法包括由单个修饰的氨基酸组成的基序，以及包含多个不变氨基酸的短基序，包括一个或多个修饰的氨基酸，例如全部或部分激酶共有底物基序，蛋白质 - 蛋白质结合基序或其他细胞 信号图案。 使用抗体的方法，例如 也提供了全基因组图谱。