公开(公告)号：US20090209759A1

公开(公告)日：2009-08-20

申请号：US12305453

申请日：2007-06-18

申请人： Brian Warrington ,  Jeremy Vinter ,  Mark Mackey

发明人： Brian Warrington ,  Jeremy Vinter ,  Mark Mackey

IPC分类号： C07D401/06 ,  C07D401/04 ,  C07D401/14

CPC分类号： G16C20/50 ,  G16B15/00

摘要： The present invention relates to methods and systems for de novo iterative synthesis, an automated iterative drug discovery method and system providing for rapid identification and synthesis of novel compounds.

摘要翻译： 本发明涉及用于从头迭代合成的方法和系统，提供快速鉴定和合成新化合物的自动化迭代药物发现方法和系统。

公开(公告)号：US20060116974A1

公开(公告)日：2006-06-01

申请号：US10526334

申请日：2003-09-05

申请人： Philip Ashworth ,  Tim Cheesright ,  Mark Mackey ,  Jeremy Vinter

发明人： Philip Ashworth ,  Tim Cheesright ,  Mark Mackey ,  Jeremy Vinter

IPC分类号： G06F17/30

CPC分类号： C40B99/00 ,  G16C20/40 ,  G16C20/90

摘要： A computer system comprising a database (100) having a plurality of records, is provided. Each record comprises a filed point representation representing field extrema for a conformation of a chemical structure. The database may include records for multiple conformations of the same chemical structure. Each record can have a searchable index of the filed point representation. In one embodiment the index is bit string. An indexing mechanism for generating an index, a searching mechanism for searching the database and a graphical user interface to enable a user to interface with the database (100) are also provided.

摘要翻译： 提供了包括具有多个记录的数据库（100）的计算机系统。 每个记录包括表示化学结构构象的场极值的场点表示。 数据库可以包括相同化学结构的多个构象的记录。 每个记录可以具有可搜索的归档点表示索引。 在一个实施例中，索引是比特串。 还提供了用于生成索引的索引机制，用于搜索数据库的搜索机制和用于使得用户能够与数据库（100）接口的图形用户界面。

公开(公告)号：US20060129323A1

公开(公告)日：2006-06-15

申请号：US10526335

申请日：2003-08-18

申请人： Tim Cheeseright ,  Mark Mackey ,  Jeremy Vinter

发明人： Tim Cheeseright ,  Mark Mackey ,  Jeremy Vinter

IPC分类号： G06F19/00

CPC分类号： G06F19/701

摘要： A method of comparing two conformers in which any score is obtained by determining the field value for molecule A at the coordinates of molecule B's field point. Molecule B's field point does not have to be very close to molecule A's field point to get a good overlay score: it just needs to be in a region where molecule A's field is large. This overcomes a limitation of conventional pseudo-Coulombic scoring in which a low score is achieved when extrema of large extent overlap but have their minimum points widely separated. The method can be applied to molecular mechanics modelling using atom centred charges (ACCs) and extended electron distributions (XEDs) as well as to quantum mechanics models.

摘要翻译： 比较两种构象异构体的方法，其中通过在分子B的场点的坐标处确定分子A的场值获得任何得分。 分子B的场点不必非常接近分子A的场点，以获得良好的叠加分数：它只需要在分子A的场域较大的区域。 这克服了常规伪库仑评分的局限性，其中在极大程度上重叠但其最小点广泛分开时实现了低分。 该方法可应用于使用原子中心电荷（ACC）和扩展电子分布（XED）以及量子力学模型的分子力学建模。