公开(公告)号：US20080052055A1

公开(公告)日：2008-02-28

申请号：US11829794

申请日：2007-07-27

申请人： Geordie Rose ,  William Macready ,  Paul Bloudoff

发明人： Geordie Rose ,  William Macready ,  Paul Bloudoff

IPC分类号： G06G7/48

CPC分类号： G16B15/00

摘要： Analog processors such as quantum processors are employed to predict the native structures of proteins based on a primary structure of a protein. A target graph may be created of sufficient size to permit embedding of all possible native multi-dimensional topologies of the protein. At least one location in a target graph may be assigned to represent a respective amino acid forming the protein. An energy function is generated based assigned locations in the target graph. The energy function is mapped onto an analog processor, which is evolved from an initial state to a final state, the final state predicting a native structure of the protein.

摘要翻译： 使用诸如量子处理器的模拟处理器来基于蛋白质的一级结构预测蛋白质的天然结构。 可以创建足够大小的目标图，以允许嵌入蛋白质的所有可能的天然多维拓扑​​。 可以分配目标图中的至少一个位置来表示形成蛋白质的相应氨基酸。 基于目标图中的分配位置生成能量函数。 能量函数被映射到模拟处理器，其从初始状态演化到最终状态，最终状态预测蛋白质的天然结构。