公开(公告)号：US20120270228A1

公开(公告)日：2012-10-25

申请号：US13542323

申请日：2012-07-05

申请人： Joffre B. Baker ,  Drew Watson ,  Tara Maddala ,  Steven Shak ,  David J. Mauro ,  Shirin K. Ford

发明人： Joffre B. Baker ,  Drew Watson ,  Tara Maddala ,  Steven Shak ,  David J. Mauro ,  Shirin K. Ford

IPC分类号： C12Q1/68

CPC分类号： C12Q1/6886 ,  C12Q2600/106 ,  C12Q2600/158

摘要： The present invention provides methods and compositions to facilitate determining whether an EGFR-expressing cancer in an individual is an EGFR inhibitor-responsive cancer, as well as methods for determining the likelihood that a patient having an EGFR-expressing cancer will exhibit a beneficial response to an EGFR inhibitor therapy. The methods generally involve determining a normalized expression level of a gene product that correlates with EGFR inhibitor responsiveness.

摘要翻译： 本发明提供了有助于确定个体中EGFR表达的EGFR是否是EGFR抑制剂反应性癌症的方法和组合物，以及用于确定具有EGFR表达癌症的患者的可能性将表现出对 EGFR抑制剂治疗。 所述方法通常涉及确定与EGFR抑制剂反应性相关的基因产物的归一化表达水平。

公开(公告)号：US08273534B2

公开(公告)日：2012-09-25

申请号：US12465503

申请日：2009-05-13

申请人： Joffre B. Baker ,  Drew Watson ,  Tara Maddala ,  Steven Shak ,  David J. Mauro ,  Shirin K. Ford

发明人： Joffre B. Baker ,  Drew Watson ,  Tara Maddala ,  Steven Shak ,  David J. Mauro ,  Shirin K. Ford

IPC分类号： C12Q1/68

CPC分类号： C12Q1/6886 ,  C12Q2600/106 ,  C12Q2600/158

摘要： The present invention provides methods and compositions to facilitate determining whether an EGFR-expressing cancer in an individual is an EGFR inhibitor-responsive cancer, as well as methods for determining the likelihood that a patient having an EGFR-expressing cancer will exhibit a beneficial response to an EGFR inhibitor therapy. The methods generally involve determining a normalized expression level of a gene product that correlates with EGFR inhibitor responsiveness.

摘要翻译： 本发明提供了有助于确定个体中EGFR表达的EGFR是否是EGFR抑制剂反应性癌症的方法和组合物，以及用于确定具有EGFR表达癌症的患者的可能性将表现出对 EGFR抑制剂治疗。 所述方法通常涉及确定与EGFR抑制剂反应性相关的基因产物的归一化表达水平。

公开(公告)号：US20090298701A1

公开(公告)日：2009-12-03

申请号：US12465503

申请日：2009-05-13

申请人： Joffre B. Baker ,  Drew Watson ,  Tara Maddala ,  Steven Shak ,  David J. Mauro ,  Shirin K. Ford

发明人： Joffre B. Baker ,  Drew Watson ,  Tara Maddala ,  Steven Shak ,  David J. Mauro ,  Shirin K. Ford

IPC分类号： C40B30/00 ,  C12Q1/68 ,  C40B40/06 ,  C40B50/14

CPC分类号： C12Q1/6886 ,  C12Q2600/106 ,  C12Q2600/158

摘要： The present invention provides methods and compositions to facilitate determining whether an EGFR-expressing cancer in an individual is an EGFR inhibitor-responsive cancer, as well as methods for determining the likelihood that a patient having an EGFR-expressing cancer will exhibit a beneficial response to an EGFR inhibitor therapy. The methods generally involve determining a normalized expression level of a gene product that correlates with EGFR inhibitor responsiveness.

摘要翻译： 本发明提供了有助于确定个体中EGFR表达的EGFR是否是EGFR抑制剂反应性癌症的方法和组合物，以及用于确定具有EGFR表达癌症的患者的可能性将表现出对 EGFR抑制剂治疗。 所述方法通常涉及确定与EGFR抑制剂反应性相关的基因产物的归一化表达水平。

公开(公告)号：US20110171633A1

公开(公告)日：2011-07-14

申请号：US12987023

申请日：2011-01-07

申请人： Wayne Cowens ,  Steven Shak ,  Audrey Goddard ,  Dejan Knezevic ,  Joffre B. Baker ,  Michael C. Kiefer ,  Tara Maddala ,  Frederick L. Baehner

发明人： Wayne Cowens ,  Steven Shak ,  Audrey Goddard ,  Dejan Knezevic ,  Joffre B. Baker ,  Michael C. Kiefer ,  Tara Maddala ,  Frederick L. Baehner

IPC分类号： C12Q1/68 ,  C12Q1/02 ,  G01N33/68

CPC分类号： C12Q1/6886 ,  C12Q2600/112 ,  C12Q2600/118 ,  C12Q2600/158 ,  G01N33/57438 ,  G06F19/00 ,  G06F19/10 ,  G06N7/005 ,  G16H50/20

摘要： The present disclosure provides gene and gene sets, the expression of which is important in the classification and/or prognosis of cancer, in particular of renal cell carcinoma.

摘要翻译： 本公开提供了基因和基因组，其表达在癌症，特别是肾细胞癌的分类和/或预后中是重要的。

公开(公告)号：US20120028264A1

公开(公告)日：2012-02-02

申请号：US13190391

申请日：2011-07-25

申请人： Steven Shak ,  Frederick L. Baehner ,  Tara Maddala ,  Mark Lee ,  Robert J. Pelham ,  Wayne Cowens ,  Diana Cherbavaz ,  Michael C. Kiefer ,  Michael Crager ,  Audrey Goddard ,  Joffre B. Baker

发明人： Steven Shak ,  Frederick L. Baehner ,  Tara Maddala ,  Mark Lee ,  Robert J. Pelham ,  Wayne Cowens ,  Diana Cherbavaz ,  Michael C. Kiefer ,  Michael Crager ,  Audrey Goddard ,  Joffre B. Baker

IPC分类号： C12Q1/68

摘要： Molecular assays that involve measurement of expression levels of prognostic biomarkers, or co-expressed biomarkers, from a biological sample obtained from a prostate cancer patient, and analysis of the measured expression levels to provide information concerning the likely prognosis for said patient, and likelihood that said patient will have a recurrence of prostate cancer, or to classify the tumor by likelihood of clinical outcome or TMPRSS2 fusion status, are provided herein.

摘要翻译： 涉及从前列腺癌患者获得的生物样品中测量预后生物标志物或共表达生物标志物的表达水平的分子测定，以及测量的表达水平的分析以提供关于所述患者的可能预后的信息，以及可能性 所述患者将具有前列腺癌的复发，或通过临床结果或TMPRSS2融合状态的可能性来分类肿瘤。

公开(公告)号：US09551034B2

公开(公告)日：2017-01-24

申请号：US12987023

申请日：2011-01-07

申请人： Wayne Cowens ,  Steven Shak ,  Audrey Goddard ,  Dejan Knezevic ,  Joffre Baker ,  Michael C. Kiefer ,  Tara Maddala ,  Frederick L. Baehner

发明人： Wayne Cowens ,  Steven Shak ,  Audrey Goddard ,  Dejan Knezevic ,  Joffre Baker ,  Michael C. Kiefer ,  Tara Maddala ,  Frederick L. Baehner

IPC分类号： C12Q1/68 ,  G01N33/574

CPC分类号： C12Q1/6886 ,  C12Q2600/112 ,  C12Q2600/118 ,  C12Q2600/158 ,  G01N33/57438 ,  G06F19/00 ,  G06F19/10 ,  G06N7/005 ,  G16H50/20

摘要： The present disclosure provides gene and gene sets, the expression of which is important in the classification and/or prognosis of cancer, in particular of renal cell carcinoma.

摘要翻译： 本公开提供了基因和基因组，其表达在癌症，特别是肾细胞癌的分类和/或预后中是重要的。

公开(公告)号：US20100151463A1

公开(公告)日：2010-06-17

申请号：US12554783

申请日：2009-09-04

申请人： Frederick L. Baehner ,  Drew Watson ,  Tara Maddala ,  Steve Shak ,  Robert Gray ,  Joseph Sparano

发明人： Frederick L. Baehner ,  Drew Watson ,  Tara Maddala ,  Steve Shak ,  Robert Gray ,  Joseph Sparano

IPC分类号： C12Q1/68

CPC分类号： C12Q1/6886 ,  C12Q2600/106 ,  C12Q2600/112 ,  C12Q2600/158

摘要： The present disclosure provides methods for determining the HER2 Status of a cancer tumor sample.

摘要翻译： 本公开提供了确定癌症肿瘤样品的HER2状态的方法。