公开(公告)号：US06990238B1

公开(公告)日：2006-01-24

申请号：US09410367

申请日：1999-09-30

申请人： Jeffrey D. Saffer ,  Augustin J. Calapristi ,  Nancy E. Miller ,  Randall E. Scarberry ,  Sarah J. Thurston ,  Susan L. Havre ,  Scott D. Decker ,  Deborah A. Payne ,  Heidi J. Sofia ,  Gregory S. Thomas ,  Lisa C. Stillwell ,  Guang Chen ,  Vernon L. Crow ,  Cory L. Albright ,  Sean J. Zabriskie ,  Kevin M. Groch ,  Joel M. Malard ,  Lucille T. Nowell

发明人： Jeffrey D. Saffer ,  Augustin J. Calapristi ,  Nancy E. Miller ,  Randall E. Scarberry ,  Sarah J. Thurston ,  Susan L. Havre ,  Scott D. Decker ,  Deborah A. Payne ,  Heidi J. Sofia ,  Gregory S. Thomas ,  Lisa C. Stillwell ,  Guang Chen ,  Vernon L. Crow ,  Cory L. Albright ,  Sean J. Zabriskie ,  Kevin M. Groch ,  Joel M. Malard ,  Lucille T. Nowell

IPC分类号： G06K9/62

CPC分类号： G06F17/30716 ,  G06F17/30991 ,  G06F19/00 ,  G06K9/6218 ,  G06K9/6253 ,  Y02A90/26 ,  Y10S707/99931

摘要： A system or method consistent with an embodiment of the present invention is useful in analyzing large volumes of different types of data, such as textual data, numeric data, categorical data, or sequential string data, for use in identifying relationships among the data types or different operations that have been performed on the data. A system or method consistent with the present invention determines and displays the relative content and context of related information and is operative to aid in identifying relationships among disparate data types. Various data types, such as numerical data, protein and DNA sequence data, categorical information, and textual information, such as annotations associated with the numerical data or research papers may be correlated for visual analysis. A variety of user-selectable views may be correlated for user interaction to identify relationships that exist among the different types of data or various operations performed on the data.Furthermore, the user may explore the information contained in sets of records and their associated attributes through the use of interactive 2-D line charts and interactive summary miniplots.

摘要翻译： 与本发明的实施例一致的系统或方法可用于分析大量不同类型的数据，例如文本数据，数字数据，分类数据或连续字符串数据，以用于识别数据类型之间的关系或 对数据执行的不同操作。 与本发明一致的系统或方法确定并显示相关信息的相对内容和上下文，并且有助于识别不同数据类型之间的关系。 可以将各种数据类型，例如数值数据，蛋白质和DNA序列数据，分类信息和文本信息（例如与数字数据或研究论文相关联的注释）相关联以进行视觉分析。 可以将各种用户可选择的视图相关联用于用户交互以识别不同类型的数据之间存在的关系或对数据执行的各种操作。 此外，用户可以通过使用交互式二维线图和交互式摘要小型图来探索包含在记录集中的信息及其相关属性。

公开(公告)号：US06940509B1

公开(公告)日：2005-09-06

申请号：US09675515

申请日：2000-09-29

申请人： Vernon L. Crow ,  Randall E. Scarberry ,  Augustin J. Calapristi ,  Nancy E. Miller ,  Jeffrey D. Saffer

发明人： Vernon L. Crow ,  Randall E. Scarberry ,  Augustin J. Calapristi ,  Nancy E. Miller ,  Jeffrey D. Saffer

IPC分类号： G06T11/20 ,  G06T11/00

CPC分类号： G06T11/206

摘要： Systems and methods provide several enhancements for the viewing, analysis, and generation of landscape views in a data analysis system, including: allowing a user to select from multiple methods to generate a landscape view, providing labels for peaks of a landscape, enabling the user to replace labels displayed on the landscape view, enabling a landscape view to be recalculated based on the replacement labels, and allowing a user to switch or morph between two landscape views generated by different methods. Such methods or systems generate graphical landscape map visualizations from a set of data records.

摘要翻译： 系统和方法为数据分析系统中的景观视图的查看，分析和生成提供了几个增强功能，包括：允许用户从多种方法中选择生成横向视图，为景观的峰值提供标签，使用户 以替换横向视图中显示的标签，可以根据替换标签重新计算横向视图，并允许用户在由不同方法生成的两个横向视图之间进行切换或变形。 这样的方法或系统从一组数据记录生成图形横向地图可视化。

公开(公告)号：US06898530B1

公开(公告)日：2005-05-24

申请号：US09409260

申请日：1999-09-30

申请人： Jeffrey D. Saffer ,  Augustin J. Calapristi ,  Nancy E. Miller ,  Randall E. Scarberry ,  Heidi J. Sofia ,  Lisa C. Stillwell ,  Guang Chen ,  Philip J. Monroe

发明人： Jeffrey D. Saffer ,  Augustin J. Calapristi ,  Nancy E. Miller ,  Randall E. Scarberry ,  Heidi J. Sofia ,  Lisa C. Stillwell ,  Guang Chen ,  Philip J. Monroe

IPC分类号： G06F17/30 ,  G06F19/22 ,  G06F19/28 ,  G01N33/48 ,  G01N31/00

CPC分类号： G06F19/22 ,  G06F19/28

摘要： Systems for creating high-dimensional vectors representing sequence strings and biopolymer materials are provided. A first system for divides respective sequence strings into blocks of at least three units to create a vocabulary of blocks. A second system selects predefined domains of a plurality of items of biopolymer materials. A third system defines each item of biopolymer material in a data set of biopolymer materials as a surface using descriptors of at least one of structure and function. A fourth system compares information regarding each biopolymer material of a plurality of biopolymer materials to information regarding each other biopolymer material.

摘要翻译： 提供了用于创建表示序列串和生物聚合物材料的高维向量的系统。 用于将各个序列串划分为至少三个单元的块的第一系统，以创建块的词汇表。 第二系统选择多个生物聚合物材料的预定义域。 第三系统使用结构和功能中的至少一个的描述符将生物聚合物材料的数据集中的每一项生物聚合物材料定义为表面。 第四系统将关于多种生物聚合物材料的每种生物聚合物材料的信息与关于彼此生物聚合物材料的信息进行比较。

公开(公告)号：US06718336B1

公开(公告)日：2004-04-06

申请号：US09672622

申请日：2000-09-29

申请人： Jeffrey D. Saffer ,  Augustin J. Calaprist ,  Guang Chen ,  Vernon L. Crow ,  Jonathon D. McCall ,  Nancy E. Miller ,  Philip J. Monroe ,  Lucille T. Nowell ,  Deborah A. Payne ,  Randall E. Scarberry ,  Lisa C. Stillwell ,  Sarah J. Thurston ,  Leigh K. Williams ,  Sean J. Zabriskie

发明人： Jeffrey D. Saffer ,  Augustin J. Calaprist ,  Guang Chen ,  Vernon L. Crow ,  Jonathon D. McCall ,  Nancy E. Miller ,  Philip J. Monroe ,  Lucille T. Nowell ,  Deborah A. Payne ,  Randall E. Scarberry ,  Lisa C. Stillwell ,  Sarah J. Thurston ,  Leigh K. Williams ,  Sean J. Zabriskie

IPC分类号： G06F1730

CPC分类号： G06F17/30557 ,  Y10S707/99943

摘要： A data import system enables access to data of multiple types from multiple data sources of different formats and provides an interface for importing data into a data analysis system. The interface enables a user to customize the formatting of the data as the data is being imported into a data analysis system. A user may select first user defined options for operating on a first data set received during a data importation process. An intermediate representation of the data set is generated based on the user first defined options. A user may specify second user defined options based on the intermediate representation during the data importation process. The second user defined options are processed to produce a final data representation of the data set to be used for analysis of the data. The intermediate representation may be a data table. The processing of a data set may include merging a first and second data set to produce the final data representation. The second user defined options may enable a user to select a basic operation for merging the data sets or to select a non-basic operation for merging the data sets. The basic operation may combine data sets in response to a user's selection of a first graphical interface control, and the non-basic operation may combine the data sets based on user selection of at least two graphical interface controls from a group of graphical interface controls.

摘要翻译： 数据导入系统可以访问来自不同格式的多个数据源的多种类型的数据，并提供用于将数据导入数据分析系统的接口。 该界面使用户能够在将数据导入数据分析系统时自定义数据的格式。 用户可以选择用于在数据导入过程期间接收的第一数据集上操作的第一用户定义的选项。 基于用户首先定义的选项生成数据集的中间表示。 用户可以在数据导入过程期间基于中间表示来指定第二用户定义的选项。 处理第二个用户定义的选项以产生要用于数据分析的数据集的最终数据表示。 中间表示可以是数据表。 数据集的处理可以包括合并第一和第二数据集以产生最终数据表示。 第二用户定义的选项可以使得用户能够选择用于合并数据集的基本操作或者选择用于合并数据集的非基本操作。 基本操作可以响应于用户对第一图形界面控件的选择来组合数据集，并且非基本操作可以基于来自一组图形界面控件的至少两个图形界面控件的用户选择来组合数据集。

公开(公告)号：US06665661B1

公开(公告)日：2003-12-16

申请号：US09672599

申请日：2000-09-29

申请人： Vernon L. Crow ,  Randall E. Scarberry ,  Augustin J. Calaprist ,  Nancy E. Miller ,  Grant C. Nakamura ,  Jeffrey D. Saffer

发明人： Vernon L. Crow ,  Randall E. Scarberry ,  Augustin J. Calaprist ,  Nancy E. Miller ,  Grant C. Nakamura ,  Jeffrey D. Saffer

IPC分类号： G06F1730

CPC分类号： G06F17/30616 ,  Y10S707/99932 ,  Y10S707/99933

摘要： Methods and systems are provided that enable text in various sections of data records to be separately catalogued, indexed, or vectorized for analysis in a text visualization and mining system. A text processing system receives a plurality of data records, where each data record has one or a plurality of attribute fields associated with the records. The attributes fields containing textual information are identified. The specific textual content of each attribute field is identified. An index is generated that associates the textual content contained in each attribute field with the attribute field containing the textual content. The index is operable for use in text processing. The plurality of data records may be located in a data table and the textual information may be contained within cells of the data table. In another aspect, a plurality of data records is received, where at least some of the data records contain text terms. A first method is applied to weight text terms of the data records in a first manner to aid in distinguishing records from each other in response to selection of the first method. A second method is applied to weight text terms of the data records in a second manner to aid in distinguishing records from each other in response to selection of the second method. A vector is generated to distinguish each of the data records based on the text terms weighted by either the first or second method.

摘要翻译： 提供了方法和系统，使数据记录的各个部分的文本可以单独编目，索引或向量化，以便在文本可视化和挖掘系统中进行分析。 文本处理系统接收多个数据记录，其中每个数据记录具有与记录相关联的一个或多个属性字段。 标识包含文本信息的属性字段。 识别每个属性字段的特定文本内容。 生成将每个属性字段中包含的文本内容与包含文本内容的属性字段相关联的索引。 该索引可操作用于文本处理。 多个数据记录可以位于数据表中，并且文本信息可以包含在数据表的单元内。 在另一方面，接收多个数据记录，其中至少一些数据记录包含文本术语。 应用第一种方法以第一种方式对数据记录的文本术语进行加权，以帮助响应于第一种方法的选择来区分记录。 应用第二种方法以第二种方式对数据记录的文本术语进行加权，以帮助响应于第二种方法的选择来区分记录。 生成矢量以基于由第一或第二方法加权的文本项来区分每个数据记录。

公开(公告)号：US07106329B1

公开(公告)日：2006-09-12

申请号：US09408716

申请日：1999-09-30

申请人： Nancy E. Miller ,  Jeffrey D. Saffer ,  Randall E. Scarberry ,  Scott D. Decker ,  Sean J. Zabriskie

发明人： Nancy E. Miller ,  Jeffrey D. Saffer ,  Randall E. Scarberry ,  Scott D. Decker ,  Sean J. Zabriskie

IPC分类号： G06T11/20

CPC分类号： G06F17/30572

摘要： Methods and apparatus allow a user to explore the information contained in sets of records and their associated attributes through the use of interactive surface maps. The records may contain various types of attributes, including text, numeric, categoric, and sequence data.

摘要翻译： 方法和装置允许用户通过使用交互式表面图来探索记录集合及其相关属性中包含的信息。 记录可以包含各种类型的属性，包括文本，数字，分类和序列数据。