目标物种
1. 目标物种特有序列的获取方法及目标物种检测方法
申请号: CN202011120316.6
申请日: 2020-10-19
公开（公告）号: CN112331268B
公开（公告）日: 2023-04-14
发明人: 陈艳朋; 邓操; 刘梦佳; 郝兆楠
本发明涉及目标物种特有序列的获取方法及目标物种检测方法，目标物种特有序列的获取方法包括以下步骤：选择基因组数据库中目标物种的所有全基因组序列，并通过对目标物种的所有全基因组序列的比对，筛选出目标物种核心序列；过滤掉核酸数据库中的所述目标物种的所有核酸序列，得到非目标物种核酸序列数据库；将目标物种核心序列与非目标物种核酸序列数据库进行比对，过滤掉目标物种核心序列中比对到的核酸序列，最终得到目标物种特有序列。通过上述方法可获得目标物种特有序列，方法简单，且可靠性高，通过鉴定样本中是否有目标物种特有序列的存在，即可确定生物的目标物种及分类地位。因此只需扩增本发明目标物种特有序列的获取方法得到的目标物种特有序列，即可鉴定目标物种的存在或目标物种分类地位。
更多2. 目标物种特有序列的获取方法及目标物种检测方法
申请号: CN202011120316.6
申请日: 2020-10-19
公开（公告）号: CN112331268A
公开（公告）日: 2021-02-05
发明人: 陈艳朋; 邓操; 刘梦佳; 郝兆楠
本发明涉及目标物种特有序列的获取方法及目标物种检测方法，目标物种特有序列的获取方法包括以下步骤：选择基因组数据库中目标物种的所有全基因组序列，并通过对目标物种的所有全基因组序列的比对，筛选出目标物种核心序列；过滤掉核酸数据库中的所述目标物种的所有核酸序列，得到非目标物种核酸序列数据库；将目标物种核心序列与非目标物种核酸序列数据库进行比对，过滤掉目标物种核心序列中比对到的核酸序列，最终得到目标物种特有序列。通过上述方法可获得目标物种特有序列，方法简单，且可靠性高，通过鉴定样本中是否有目标物种特有序列的存在，即可确定生物的目标物种及分类地位。因此只需扩增本发明目标物种特有序列的获取方法得到的目标物种特有序列，即可鉴定目标物种的存在或目标物种分类地位。
更多3. 目标物种潜在入侵风险评估方法及装置
申请号: CN202210119592.3
申请日: 2022-02-09
公开（公告）号: CN114154428B
公开（公告）日: 2022-09-23
发明人: 江东; 丁方宇; 郝蒙蒙; 付晶莹
本发明是关于一种目标物种潜在入侵风险评估方法及装置，其中，方法包括：获取目标物种的分布记录数据和多维时空数据；根据所述分布记录数据和多维时空数据，使用最大熵模型生成伪缺失概率分布数据，并从所述伪缺失概率分布数据中随机筛选出与所述分布记录数据等量的伪缺失样本数据；根据所述伪缺失样本数据、所述分布记录数据和多维时空数据，构建并训练得到一个基于多个增强回归树模型的机器学习集成模型；通过所述机器学习集成模型，确定驱动所述目标物种入侵风险的关键影响因素，确定所述目标物种的入侵概率，评估潜在入侵风险区分布和量化评估的不确定性。
更多4. 目标物种潜在入侵风险评估方法及装置
申请号: CN202210119592.3
申请日: 2022-02-09
公开（公告）号: CN114154428A
公开（公告）日: 2022-03-08
发明人: 江东; 丁方宇; 郝蒙蒙; 付晶莹
本发明是关于一种目标物种潜在入侵风险评估方法及装置，其中，方法包括：获取目标物种的分布记录数据和多维时空数据；根据所述分布记录数据和多维时空数据，使用最大熵模型生成伪缺失概率分布数据，并从所述伪缺失概率分布数据中随机筛选出与所述分布记录数据等量的伪缺失样本数据；根据所述伪缺失样本数据、所述分布记录数据和多维时空数据，构建并训练得到一个基于多个增强回归树模型的机器学习集成模型；通过所述机器学习集成模型，确定驱动所述目标物种入侵风险的关键影响因素，确定所述目标物种的入侵概率，评估潜在入侵风险区分布和量化评估的不确定性。
更多5. 一种直测流动液体高浓度目标物种浓度的方法
申请号: CN202310695060.9
申请日: 2023-06-13
公开（公告）号: CN116840183A
公开（公告）日: 2023-10-03
发明人: 段宁
本发明公开了一种直测流动液体高浓度目标物种浓度的方法，其中，所述方法包括步骤：通过测定目标物种的定性光程和定量光程，构建波长‑浓度模型和算法，可在紫外可见光和近红外光的波长区域内实时测定液体目标物种的光度信号和浓度。运行时液体流过设备，定性光程确定目标物种的种类，定量光程维持合理的高吸光度并测定液体的波长，由此计算目标物种浓度；不投加化学药剂、不稀释溶液，10秒内测定流动液体中高浓度目标物种原价态原形态原相态浓度。
更多6. 一种直测流动液体高浓度目标物种浓度的方法
申请号: CN202310695060.9
申请日: 2023-06-13
公开（公告）号: CN116840183B
公开（公告）日: 2024-05-24
发明人: 段宁
本发明公开了一种直测流动液体高浓度目标物种浓度的方法，其中，所述方法包括步骤：通过测定目标物种的定性光程和定量光程，构建波长‑浓度模型和算法，可在紫外可见光和近红外光的波长区域内实时测定液体目标物种的光度信号和浓度。运行时液体流过设备，定性光程确定目标物种的种类，定量光程维持合理的高吸光度并测定液体的波长，由此计算目标物种浓度；不投加化学药剂、不稀释溶液，10秒内测定流动液体中高浓度目标物种原价态原形态原相态浓度。
更多7. 一种时序物种进化的小样本目标检测装置及方法
申请号: CN202111326861.5
申请日: 2021-11-10
公开（公告）号: CN114049371A
公开（公告）日: 2022-02-15
发明人: 刘祥龙; 赵晓薇; 马宇晴; 乔艺
本发明公开了一种时序物种进化的小样本目标检测装置和方法。该装置包括：突变模块，用于针对小样本中基础样本和新样本，分别生成基础候选区域和新候选区域后进行合并，得到合并候选区域；检测器，用于根据合并候选区域，识别小样本中基础样本和新样本。本发明解决了检测样本中基础类别的信息和知识继承性差，缺乏对新类别的非特异性变化的问题，并且产生足够的高质量正样本候选区域，有效优化了小样本目标检测装置的检测性能。
更多8. 一种基于物种保护的多模态多目标差分进化优化方法
申请号: CN202110992612.3
申请日: 2021-08-27
公开（公告）号: CN113822406A
公开（公告）日: 2021-12-21
发明人: 冀俊忠; 吴同轩; 杨翠翠
本发明提供了一种基于物种保护策略的多模态多目标差分进化优化方法，首先随机初始化一个种群，之后将种群在决策空间划分为不同的子种群，随后从每个子种群中确定要保留至下个迭代的最优个体，最后将所选的最优个体在新的个体生成后替换掉种群中较差的个体。此外，使用一种差分进化的变体进行新个体生成的操作，提升种群的多样性。实验表明所提算法相较于其他算法在求解多模态多目标问题在决策空间有着更好的效果，在寻找距离最短地点的实际问题中相比传统进化算法能够找到分布更好的最优地点。
更多9. 基于已知序列确定目标物种中对应序列的方法和系统
申请号: CN201811291781.9
申请日: 2018-10-31
公开（公告）号: CN111128303A
公开（公告）日: 2020-05-08
发明人: 方东明; 陈晓丽; 吴晨雨; 刘欢; 刘心
本发明提出了基于已知序列确定目标物种中对应序列的方法和系统。方法包括：基于所述已知序列，确定所述已知序列的全部Kmer序列，以便获得种子序列Kmer序列集合；获取来自于所述目标物种的测序读段，并基于所述测序读段的至少一部分，确定所述测序读段的Kmer序列，以便获得测序读段Kmer序列集合；确定同时存在于所述测序读段Kmer序列集合和所述种子序列Kmer序列集合的Kmer序列作为延伸起始序列；基于重叠原则，利用所述测序读段Kmer序列集合，对所述延伸起始序列进行延伸处理，以便获得所述已知序列在所述目标物种中的对应序列。
更多10. 基于已知序列确定目标物种中对应序列的方法和系统
申请号: CN201811291781.9
申请日: 2018-10-31
公开（公告）号: CN111128303B
公开（公告）日: 2023-09-15
发明人: 方东明; 陈晓丽; 吴晨雨; 刘欢; 刘心
本发明提出了基于已知序列确定目标物种中对应序列的方法和系统。方法包括：基于所述已知序列，确定所述已知序列的全部Kmer序列，以便获得种子序列Kmer序列集合；获取来自于所述目标物种的测序读段，并基于所述测序读段的至少一部分，确定所述测序读段的Kmer序列，以便获得测序读段Kmer序列集合；确定同时存在于所述测序读段Kmer序列集合和所述种子序列Kmer序列集合的Kmer序列作为延伸起始序列；基于重叠原则，利用所述测序读段Kmer序列集合，对所述延伸起始序列进行延伸处理，以便获得所述已知序列在所述目标物种中的对应序列。
更多11. 一种基于转录组快速获取无基因组物种目标基因家族的方法
申请号: CN202210365072.0
申请日: 2022-04-07
公开（公告）号: CN116935949A
公开（公告）日: 2023-10-24
发明人: 潘铖; 钮羽群; 夏露霞; 何雪怡
本发明提供了一种基于转录组快速获取无基因组物种的目标基因家族的方法，通过选取参照物种、系列模式物种，并基于目标转录组数据，组合使用基因搜索比对软件Bioedit、进化树构建软件MEGA6和在线分析软件MEME，构建了一种可视化、不需要专业的生物信息学知识，也无需使用R语言等软件平台、运算代码撰写的，针对无基因组物种，快速、高效、准确、全面地获取目标基因家族的所有序列的方法。本发明采用该方法成功获得杭白菊的PEBP基因家族所有序列，并经一代测序验证，准确率为100％。
更多12. 一种草莓病毒-寄主物种的多目标基因芯片检测鉴定方法
申请号: CN202310801110.7
申请日: 2023-07-03
公开（公告）号: CN117143965A
公开（公告）日: 2023-12-01
发明人: 许瑾; 宋云; 尹龙龙; 李明福
本发明属于基因芯片技术领域，公开了一种草莓病毒‑寄主物种的多目标基因芯片检测鉴定方法，针对草莓轻型黄边病毒SMYEV、草莓坏死休克病毒SNSV、草莓镶脉病毒SVBV、草莓斑驳病毒SMoV以及草莓潜隐环斑病毒SLRSV的五种病毒，结合寄主草莓物种的属级别进行快速鉴定技术分析；通过特异引物和探针设计，以聚苯乙烯微孔板作为芯片基片，建立草莓病毒‑寄主物种的多目标基因芯片检测鉴定技术。本发明针对常见的草莓病毒和草莓物种生物信息的特点，建立草莓病毒以及草莓物种鉴定的多目标芯片检测体系，满足草莓种苗生产中病毒监测和品控需要；在检测病毒时兼顾草莓物种身份信息查验，为提高草莓种苗质量安全监管效率提供支持。
更多13. 草木樨属18个物种植物条形码的目标条形码基因及其制备方法
申请号: CN201610097677.0
申请日: 2016-02-23
公开（公告）号: CN105603095B
公开（公告）日: 2017-07-18
发明人: 张吉宇; 吴凡; 骆凯; 张代玉; 王彦荣
本发明涉及一种鉴定草木樨属18个物种植物DNA条形码技术及其应用方法。挑选整合ITS、psbA‑trnH、rbcL、matK、trnL这5个基因作为鉴定草木樨18个种的目标DNA条形码基因。基于ContigExpress的数据组织、编辑和分析法及ClustalW的多序列比对法，基于最小进化原理的Neighbor‑Joining算法和no of difference方法构建聚类图，形成一种鉴定草木樨属18个物种植物DNA条形码技术的基本用法，确立标准分类条形码基因及对应序列。该技术建立了一种快捷、高效、准确率高的草木樨属不同物种DNA条形码鉴定方法，对草木樨属各物种的区分及种质资源的利用具有重要意义。
更多14. 草木樨属18个物种植物条形码的目标条形码基因及其制备方法
申请号: CN201610097677.0
申请日: 2016-02-23
公开（公告）号: CN105603095A
公开（公告）日: 2016-05-25
发明人: 张吉宇; 吴凡; 骆凯; 张代玉; 王彦荣
本发明涉及一种鉴定草木樨属18个物种植物DNA条形码技术及其应用方法。挑选整合ITS、psbA-trnH、rbcL、matK、trnL这5个基因作为鉴定草木樨18个种的目标DNA条形码基因。基于ContigExpress的数据组织、编辑和分析法及ClustalW的多序列比对法，基于最小进化原理的Neighbor-Joining算法和no of difference方法构建聚类图，形成一种鉴定草木樨属18个物种植物DNA条形码技术的基本用法，确立标准分类条形码基因及对应序列。该技术建立了一种快捷、高效、准确率高的草木樨属不同物种DNA条形码鉴定方法，对草木樨属各物种的区分及种质资源的利用具有重要意义。
更多15. 基于跨层特征融合和线性注意力优化的跨物种目标检测方法
申请号: CN202310228601.7
申请日: 2023-03-10
公开（公告）号: CN116246147A
公开（公告）日: 2023-06-09
发明人: 冯志勇; 郭天泽; 邢猛; 陈仁海
本发明公开一种基于跨层特征融合和线性注意力优化的跨物种目标检测方法，利用混合自注意力编码器模块获取全局的上下文信息，建立起对目标的远程依赖，提取提取跨物种目标的各层级特征；利用交叉注意力解码器模块，充分融合各层级特征，实现低层信息和高层信息的联合编码和对齐，调节各特征信息对输出特征的贡献大小，突出有效信息，抑制冗余信息；最后利用关键点热图检测模块，根据编码器‑解码器建模的目标特征，对目标所在位置进行预测。本发明能充分融合各层级特征，提升跨物种目标检测的准确率；通过将其中注意力过程分解优化，以降低跨物种目标检测的性能开销。
更多16. Monitoring target endogenous species
申请号: EP08153956.1
申请日: 2008-04-02
公开（公告）号: EP2106746A1
公开（公告）日: 2009-10-07
发明人: Lowry, John; Finnerty, Niall; Brown, Finbar
An electrode comprising a conducting substrate for detecting species such as nitric oxide (NO), carbon monoxide (CO), oxygen (O2) and hydrogen (H2) and a polymer matrix formed from a first layer only or first and second layers with the second layer applied to the first. The matrix forms a permselective barrier. Each layer has a first pre-coat or first and second pre-coats. Each pre-coat may be formed by: depositing a liquid form of at least one halogenated polymer such as fluorinated or chlorinated polymers onto a substrate and allowing the material to dry. A liquid form of at least one halogenated polymer adheres the first and second layers to the substrate. The electrode allows for detection of the target species and allows real time in vivo measurements to be taken. Blood flow can also be monitored. An electrode bundle with electrodes for different target species is also provided.
17. 종 동정에 사용하기 위한 보편적 표적
申请号: KR1019970707573
申请日: 1996-04-26
公开（公告）号: KR1019990008049A
公开（公告）日: 1999-01-25
发明人: 스위한고흐; 앤소니더블유.초우; 숀헤밍센
본 발명은 올리고뉴클레오티드 프라이머 및 이들 프라이머를 유기체 종의 동정에 사용하는 방법을 제공하며, 여기서, 동정은 열 쇼크 폴리펩티드의 고도로 보존된 영역을 암호화하는 가변 폴리뉴클레오티드 서열의 증폭 반응을 포함한다.
更多18. MONITORING TARGET ENDOGENOUS SPECIES
申请号: US12739818
申请日: 2008-10-21
公开（公告）号: US20110129893A1
公开（公告）日: 2011-06-02
发明人: Maryanne Dalton; John Lowry
An electrode comprising: a conducting substrate for detecting an electroactive agent; a catalytic agent held on the substrate for converting a non-electroactive agent to an electroactive agent by a catalytic process which consumes oxygen; and an oxygen reservoir, for releasing oxygen to feed the catalytic process, held within a polymer matrix on the substrate. The electrode allows for detection of materials such as glucose when using oxidase enzymes. The invention solves the problem of fluctuation or depletion of oxygen in the environment in which the measurements are being taken.
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