本发明公开了一个Arf6激活蛋白及其编码基因与应用，其目的是提供一个Arf6激活蛋白ArfGAP-6及其编码基因与其在抑制Arf6活性中的应用。本发明抑制Arf6活性的方法，是将Arf6激活蛋白ArfGAP-6编码基因的GAP结构域发生点突变或缺失突变，或将Arf6激活蛋白ArfGAP-6编码基因的小干扰RNA的编码基因导入宿主细胞，则Arf6的活性被抑制。本发明的ARFGAP-6及其编码基因将在医学及制药领域发挥重要作用，应用前景广阔。