本发明提供一种用于内燃机的故障保护控制设备及故障保护控制方法。当检测出为每个气缸组设置的多个可变气门特性机构中的任意一个出故障时，获得故障状态下的气门特性中的有效开度(气门升程量、气门工作角等)。当判断出有效开度为预定值或大于预定值时，将正常可变气门特性机构的气门特性控制为与故障状态中的气门特性相一致。当判断出有效开度小于预定值时，执行这样一种控制，所述控制用于限制使得正常可变气门特性机构的气门特性与故障状态下的气门特性相一致的控制。