一种依据负序电压确定长定子发生不对称短路故障的方法，在每个支路的电源侧，装设能监测定子三相电压及能监测定子支路是否与供电电源断开的继电保护装置，监测三相主频电压的正序电压、负序电压及该支路与供电电源的连接状态；当所述支路中负序电压幅值与正序电压幅值之比大于整定值，同时负序电压幅值大于测量系统最大绝对误差，并且所述支路与供电电源断开时，判定该支路发生了不对称短路故障，并发出告警信号。本发明可以用于高速磁浮交通系统中，即使在某支路因故障而与供电电源断开之后，也可以在磁浮列车经过故障定子线圈时，根据故障支路中的负序电压特征迅速判断，发出告警信号并控制列车制动，确保安全运行。