一种船舶压载水管理系统的除氢方法和装置，将电解产生的夹杂着氢气的次氯酸钠溶液，以较高的流速从入口沿圆周切线方向进入筒体而产生旋转运动，在离心力的作用下，次氯酸钠水溶液被甩向筒壁，在筒心形成负压，从而使氢气从溶液中分离出来，在筒心聚集并向上经孔板、波纹板、隔沫网、单向逆止阀、限流螺栓和排气口排出；而次氯酸钠溶液则经由筒体下部的排液口输送至压载水主管路中。本发明的有益效果是：使用本发明的方法和装置，可使电解法船舶压载水管理系统的除氢装置体积减小60%。测试实验证明，除氢效率达到100%，实现完全除氢，是一种小型化的、高效、安全的除氢方法和装置。