本发明公开了一种含三氟甲基的吲哚酮类化合物及其制备方法和应用。所述化合物是具有化学结构通式I：的化合物，其中：Y为碳或氧元素；或是具有化学结构通式II：的化合物，其中：Y为碳或氧元素，X为氧或硫元素；或是具有化学结构通式III：的化合物，其中：Y为氢或卤素元素，X为氧或硫元素；或是具有化学结构通式Ⅳ：的化合物，其中：Y为氢或卤素元素。该类化合物是在有机溶剂中，由取代的苯胺与三氟丙酮酸甲酯或三氟丙酮酸乙酯在微波反应器中反应而得。本发明提供的含三氟甲基的吲哚酮类化合物具有抗HIV逆转录酶活性且对细胞基本无毒性，可望作为HIV逆转录酶抑制剂，对HIV逆转录酶抑制剂的研究具有重要价值。