本发明公开了属于航天电子系统中的时钟选择技术领域的一种时钟多选一电路及多选一方法。该时钟多选一电路由时钟计数器模块、时钟选择信号发生器模块和时钟选择器模块串联组成；利用现场可编程逻辑门阵列实现自主可靠地对同频多时钟源进行筛选。时钟计数器模块对每路输入时钟信号进行循环计数，由时钟选择信号发生器模块检测时钟信号有效性并输出时钟选择信号，时钟选择器模块对输入时钟信号进行选择并输出其中一路时钟信号。本发明对电路中的寄存器使用三模冗余技术，增强了发生单粒子翻转效应时电路的可靠性，解决了目前技术中进行同频时钟的多对一检测时存在错检的问题，降低了系统成本、复杂度和耦合度，提高了系统效能和可靠性。