本发明公开了一种桔小实蝇抗菌肽及其衍生物和应用。该抗菌肽的氨基酸序列如SEQ ID NO：1所示。其衍生物为经过修饰得到的具有抗菌效果的活性衍生物，或经过一个或多个氨基酸残基的取代、缺失或添加而形成的具有抗菌功能的桔小实蝇抗菌肽衍生物。本发明获得的桔小实蝇抗菌肽BH‑AMP003具有生物活性，具有广泛的抗菌作用。因此，本发明的桔小实蝇抗菌肽BH‑AMP003可应用于制备抗病菌类产品，抗病菌类产品包括饲料添加剂、兽药、防腐剂、医药产品如抗菌药物等。