一种含苯环的疏水有机聚磷酸铵阻燃剂及其制备方法，是在熔融状态下利用9,10-二氢-9-氧杂-10-磷杂菲-10-氧化物的P-H键与三聚氰胺的-NH2发生反应，生成一种三聚氰胺盐，再加入磷酸铵类物质与之反应，得到疏水有机聚磷酸铵阻燃剂。该阻燃剂的晶型结构为Ⅱ型聚磷酸铵，分子结构中含有苯环等有机基团，表现出良好的疏水性，接触角达到105°，能够显著提高其与高聚物之间的相容性；25℃下，100ml水中有机聚磷酸铵的溶解度仅为0.08g，80℃下，溶解度为0.20g，远高于工业聚磷酸铵水溶性小于0.5g/100ml（25℃）的要求；该阻燃剂的热稳定性高于商业聚磷酸铵，更容易满足高聚物的加工要求，不会在加工过程中发生降解而降低其阻燃性。本发明制备的有机聚磷酸铵无需后续表面处理即可直接应用于高聚物中实施阻燃，且遇潮后不易溶出。