本发明公开了一种用于SDH时钟抖动测试的装置及方法，包括电源模块、信号输入模块、光电转换模块、差分放大模块、时钟恢复模块、跟踪时钟恢复模块、抖动恢复模块、信号调理模块、A/D转换模块，FPGA抖动测试模块、PXI总线控制模块和上位机模块；首先，本发明采用FPGA抖动测试模块，避免了昂贵的测试仪器的使用，节省了SDH时钟抖动测试的成本；其次，本发明采用集成化的时钟恢复芯片ADN2812、差分放大器ADL5565和接口芯片PCI9054等，减小了测试电路的面积和复杂性，也减少了PLL电路的使用；最后，本发明采用上位机模块对FPGA抖动测试模块控制测试的方式，减少了模拟电路的使用，使SDH时钟抖动的测试结果更加的可靠。