本发明公开了一种电动汽车用永磁同步电机冷却系统及其控制方法，冷却系统包括控制单元、电机绕组电流计、冷却水泵、冷却水套、冷却水温传感器、冷却液流量计、散热器以及冷却风扇。控制方法通过检测通过电机定子绕组的电流来判断永磁同步电机在该工况下是有升温还是降温的趋势，调节冷却系统的冷却能力，从而实现冷却系统的主动调节；同时还引入辅助反馈调节，通过电机效率MAP图查询电机的工作点，得到电机在对应工况下的效率，计算电机的发热量，然后将电机发热量与散热器的散热量的差值反馈至控制单元对冷却系统的调节进行修正。本发明在电机温度发生变化之前对冷却系统进行主动冷却控制，在保证充足的电机散热能力的同时节约能源。