本发明公开了超临界抗溶剂法制备柚皮素/羟丙基‑β‑环糊精微胶囊的方法，包括如下步骤：步骤S1，将柚皮素和羟丙基‑β‑环糊精溶解于有机溶剂中，得到样品溶液；步骤S2，将CO2通入结晶釜中，调节结晶釜内的温度和压力；步骤S3，继续以一定流速通入CO2，维持结晶釜内的温度和压力不变，同时将步骤S1制备的样品溶液通入结晶釜中；步骤S4，样品溶液通入完毕后，持续通入CO2，维持结晶釜内的温度和压力不变，一段时间后卸压；当结晶釜内压力降至大气压后，打开结晶釜收集柚皮素/羟丙基‑β‑环糊精微胶囊。本发明提供的方法利用超临界抗溶剂法将柚皮素包合于HP‑β‑CD中，极大地提高了柚皮素在水溶液中的溶解性能，溶出度显著提高，有利于提高柚皮素的生物利用度。