本发明提供一种基于碳交易的城市汽车尾气排放总量控制系统，其包括设置于交通管理部门的尾气排放费用结算平台和与所述尾气排放费用结算平台保持通信连接的家用汽车，所述尾气排放费用结算平台用于计算每个汽车的尾气排放统计量，并比较所述尾气排放统计量与设定的标准排放量，当所述尾气排放统计量大于所述标准排放量时，根据所述尾气排放统计量超出所述标准排放量的超额排放数统计量向汽车车主收取尾气排放量超标费。本发明还提供一种基于碳交易的城市汽车尾气排放总量控制方法。