本发明公开了一种基于公交车GPS数据的路段公交车渗透率估计方法，包括如下步骤：步骤1：根据回传的公交车GPS数据确定公交车停车排队的位置；步骤2：在信号灯红灯周期结束时刻，找出排队队列中的公交车的数量D，根据步骤1中得到的公交车停车排队的位置，找出排队队列中的最后一辆公交车的位置llst_stop；对大量的历史数据进行分析找出对应线路的交叉口停车线的位置lline_stop，计算出单周期的公交车渗透率；步骤3：对不同时期单周期的公交车渗透率进行分析，选择合适的周期数M作为多周期渗透率的时间窗；步骤4：根据步骤3选择的时间窗大小，选择DBSCAN密度聚类算法对不同时期多周期的渗透率进行聚类，根据聚类结果，对多周期的渗透率进行加权，得到公交车的渗透率。