本发明公开了一种利于模糊核估计的图像区域选择方法和系统，其中方法的实现包括：计算模糊图像中每一像素点的相对总变分值并得到其相对总变分映射图；设定阈值确定图像中每一像素点是否为边界像素点；再对模糊图像以及其相对总变分映射图进行采样，得到一系列图像块；最后统计每一图像块中边界像素点的数量并选择出有利于模糊核估计的图像区域。本发明有效解决了现有区域选择方法中存在的过于依赖操作者经验，效率低等问题，自动选择出有利于模糊核估计的图像区域，适用于图像去模糊算法中模糊核估计的应用场合。