本发明提供一种永磁同步直线电机进给系统机电耦合建模方法，包括以下步骤：1.利用电磁能量法分析与计算永磁同步直线电机伺服输出推力的频谱特征；2.利用拉格朗日方程建立永磁同步直线电机进给系统机械动力学模型；3.分析永磁同步直线电机进给系统伺服驱动和机械系统之间的相互耦合作用关系；4.根据伺服驱动和机械系统之间的相互耦合作用关系，建立永磁同步直线电机进给系统多因素耦合机电耦合模型。本发明能够快速有效的分析系统中各类耦合问题的本质规律。同时快速可靠的评价各类机电耦合对系统运动平稳性的影响大小。进一步补充了由于机电耦合问题造成的新变化，完善了复杂机电系统的集成建模方法。