本发明涉及一种配电网中多谐波源识别方法，该方法包括以下步骤：⑴在配电网中放置谐波测量装置PMU；⑵对配电网进行PMU的优化配置：确定PMU优化配置的数学模型；利用二进制帝国竞争算法求解PMU优化配置的数学模型，即可得到配电网中PMU的优化配置方案；⑶获取配电网中配置PMU的节点处一段时间内的谐波电压数据；⑷用移动滤波器获得谐波电压中的快速变化分量；⑸对进行预处理，即中心化处理和白化处理；⑹将快速变化分量用于改进独立分量分析算法中，确定分离矩阵，再将分离矩阵作用于谐波电压上来分离得到注入配电网中各个谐波电流。本发明具有实现系统化、估计结果准确的特点，可用于实际配电网中谐波阻抗未知时多谐波源的识别过程中。