本发明公开了一种特种车车控系统硬件通路的在线自动检测方法，特种车车控系统包括控制器，控制器具有DO端口、DI端口、AI端口及AO端口，DO端口为开关量输出通路端口，DI端口为开关量输入通路端口，AI端口为模拟量输入通路端口，AO端口为模拟量输出通路端口；该在线自动检测方法包括开关量输出通路检测步骤、开关量输入通路检测步骤及模拟量输入输出通路检测步骤。本发明能够有效检测特种车车控系统硬件通路正常与否，具有操作简单、效率高、检测速度快等突出优点，提高了车控系统硬件通路的自动测试性，同时有效地降低了对排故人员的技能要求，排故人员只需按照说明操作即可，而无需对系统硬件非常熟知。