本发明属于水下定位、坐标获取技术领域，提供一种基于图像声呐的水下定位系统的工作方法，该系统包括图像声呐设备、两台GPS、水下探测支架和计算机，所述水下探测支架包括水平方向的横杆和竖直方向的探测杆，横杆中部设有连接杆，横杆通过连接杆插入探测杆端部，所述横杆两端分别安装GPS1和GPS2，所述探测杆底部安装图像声呐设备。本发明采用基于图像声呐的水下定位技术方法，能够在水下作业过程中，快速的获取一定目标区域内任意点在外部坐标系中的坐标值，操作简单易行，系统造价低。