本发明公开了一种细胞密度控制仪及其方法、应用，所述的细胞密度控制仪包括激光光源和沿着激光光路依次设置的准直透镜、筛网及细胞培养平台，细胞培养平台上设置温度控制装置，能够感应细胞培养平台的温度，当温度达到设定温度后关闭激光光源；细胞培养平台设置有容纳传统细胞培养板或培养皿的凹槽及固定装置，激光光源投射到准直透镜后，准直透镜将激光平行出射，平行激光经过筛网后，将激光遮挡为间隔相同的大量的平行光带投射在培养板上。利用高温导致细胞受损死亡的原理，将细胞密度控制在设定水平，为进一步明确细胞增殖能力、提高细胞质粒转染成功率提供更加可靠的手段和依据。