本发明公开了城市地下综合管廊穿地裂缝处变形缝结构及其构筑方法，变形缝设置在地裂缝上盘的主变形区衬砌和微变形区衬砌的交界处以及地裂缝下盘的主变形区衬砌和微变形区衬砌的交界处，变形缝的两侧设置有端部衬砌，端部衬砌的上端设置有外包防水层和止水带，变形缝内上端设置有且型止水带，且型止水带下方设置有环形弹性囊，变形缝下端设置U型止水带，该结构具有较好的防渗效果，可以保证综合管廊在地裂缝地层活动下的正常使用，该方法能构建地裂缝活动地层引起的综合管廊结构大位移错动条件下所需的结构。