一种基于任务自适应分配的星载计算机动态重构方法及系统，包括步骤如下：CPU之间发送心跳信息，根据心跳信息以及自身CPU标识进行系统工作模式的初始设置，通过对周期性心跳信息的监控实现系统工作模式的自主切换以及任务的动态分配和创建。通过该方法，各CPU可重新根据工作模式以及自身CPU标识启动工作任务，并支持创建和启动拓展任务，增加系统处理任务数量的能力，系统灵活性强，支持航天器在轨运行期间根据任务需要动态扩展星载计算机的软件功能，提升系统的计算能力和可靠性。