一种基于柔性铰链的微型扑翼飞行器，其特征是它包括机身（1）和电机（10），电机（10）固联在机身（1）上，电机轴（11）和一号齿轮（4）同轴枢装；二号大齿轮（6）和二号小齿轮（7）同轴并固联；一号齿轮（4）和二号大齿轮（6）啮合，二号小齿轮（7）和三号齿轮（8）啮合，三号齿轮（8）和四号齿轮（9）啮合，两个连杆（12分别同轴枢装在三号齿轮（8）和四号齿轮（9）上，摇杆（13）既和机身（1）枢装也和连杆（12）枢装；两个摇杆（13）的外端分别和柔性铰链（14）的一端相连；而翅膀（2）和柔性铰链（14）的另一端相连。本发明结构简单，重量轻，制造方便，通过柔性铰链的被动变形使翅膀能有效的翻转，解决了微型扑翼飞行器在低雷诺数下飞行的难题。