本发明提供了一种运输车辆车号与集装箱箱号关联系统，系统包括：装卸机，用于抓取集装箱，用第一摄像机拍摄得到集装箱图像；在获得确认装车指令后，将集装箱放至目标运输车辆，用第二摄像机拍摄得到目标运输车辆图像；图像识别子系统，用于识别集装箱图像得到箱号；若未获得箱号关联的源车号，向装卸机发送确认装车指令；识别目标运输车辆图像得到目标车号，用目标车号与箱号生成关联信息，向集装箱管理子系统发送关联信息；集装箱管理子系统，用于查找预设的箱号表，若查找到箱号关联的源车号，将源车号发送给图像识别子系统；按照关联信息，建立目标车号与箱号之间的关联关系。应用本发明实施例，提高了集装箱箱号与运输车辆车号关联的效率。