本发明公开了一种微生物土壤活化菌剂及其制备方法与应用，涉及微生物应用领域，基于秸秆原位还田时土壤消解慢、效率低的问题而提出的，本发明由白地霉GGC105(Geotrichum candidum)和枯草芽孢杆菌GBS118(Bacillus subtilis)按照(20-30)：(70-80)体积比组成，本发明的有益效果在于：两株菌具有互不拮抗、稳定持久、适应性强的特点；能强化秸秆腐解，兼具解磷、解钾的功能，有效活化土壤，增加有效磷、钾供给；改善土壤有益微生物数量，增加土壤对秸秆等短期难以利用生物质及矿物质的消纳及快速分解能力。