本发明涉及医疗模型领域，具体涉及一种基于3D打印的医疗模型及其制作方法，目的在于提供术前模拟训练的模型。本发明的制作方法包括以下步骤：构建目标骨骼的三维数字模型；从中提取预设个数的目标骨骼的子模型；对每个目标骨骼的子模型进行孔洞修复；构建目标软组织/器官模具的三维数字模型；根据修复后的目标骨骼的子模型和模具的三维数字模型进行3D打印，得到目标骨骼的实物模型和目标软组织/器官的模具；基于3D打印得到的模具，制作目标软组织/器官的实物模型；将目标骨骼的实物模型与目标软组织/器官的实物模型进行组合，得到医疗模型。本发明制作的模型仿真度高，可以对医务人员进行术前的有效模拟训练，提高了手术成功率。