本发明涉及一种船用大型设备基座的无余量安装方法，采用全站扫描仪对设备基座所在甲板安装位置进行测量，利用标记点进行坐标系变换，将测得的点云数据与设计模型进行匹配，再将基座腹板、肘板平面对点云数据进行切片，并计算出基座下端与甲板对接的安装余量线的数据；根据计算出的安装余量线，执行对基座下端每块腹板、肘板进行余量切割；最后将无余量的基座直接进行定位安装，在复测基座面板、确认平面度符合精度要求后，完成基座焊接工作。本发明有效地解决了基座安装甲板平面度误差的影响，使大型设备基座下端的安装相贯线可得到精确测量、安装余量一次精确切割。