本发明涉及一种公路施工区安全联控系统及方法，其包括：预先设置安全联控系统；由预置在车辆监测预警模块内的雷达不间断的监测驶来车辆，获取车辆运动参数和位置参数，并发送提示信息至安全联控系统中的车辆监测预警模块、施工区信息提示模块和车辆驾驶状态提示模块；车辆监测预警模块依据车辆闯入施工区的风险评估模型，评估车辆闯入风险的大小，进行分级预警，并发送风险等级无线信号至安全联控系统中的闯入检测报警及信号中继单元和主控制器及远程监控单元；当风险评估为有风险时，开启两层闯入检测设备：雷达和智能检测道钉，并进入下一步；根据风险等级无线信号开启三层闯入检测设备。