本发明提供了一种杂色曲霉HY12的筛选方法，包括感病斜纹夜蛾幼虫的处理；感病斜纹夜蛾的菌株初筛选；进行虫体接种试验；筛选出对斜纹夜蛾强致病性菌株并进行分子生物学鉴定。本发明提供的筛选方法，克服了传统利用土样法自然分离致病菌株效率低、针对性低、不可控、不易重复的缺陷，从斜纹夜蛾为害区采集自然死亡的感病斜纹夜蛾的幼虫，从幼虫体内腐烂的内脏中分离致病菌株，所得到的杂色曲霉HY12的发酵物可感染斜纹夜蛾，使其提前进入蛹期，对化蛹期间的斜纹夜蛾具有较高的致畸率和致死率，为后期安全有效地防治斜纹夜蛾奠定基础，为新杀虫菌剂的创制提供新颖的模板。