本发明提供了用于预测活品牡蛎捕捞时间的内源性多肽，所述的内源性多肽序列为：肽段1：SEQ ID NO.1：SSSTGEVGTYSGTTN或肽段2：SEQ ID NO.2：TARNEANVNI或肽段3：SEQ ID NO.3：TARNEANVNIY。本发明提供了用来预测活品牡蛎捕捞时间的内源性多肽，经过具体试验验证，能够证明牡蛎捕捞时间与上述肽段具有紧密的相关性，呈绝对的负相关。本发明能够进一步完善活品牡蛎流通的监测体系。