本申请公开了一种电机控制器及其控制方法，以抑制逆变器输出电流中的高次谐波。该方法包括：根据交流电机转速与逆变器开关频率之间的对应关系，计算当前转速下允许达到的最低开关频率FreqCurrent；根据Freq1、FreqMaxSet和FreqMinSet计算随机开关频率取值区间[Freq3，FreqMaxSet]中的下限值Freq3，其中Freq1为大于等于FreqCurrent的任一值，FreqMaxSet、FreqMinSet为根据系统硬件和控制性能要求综合考虑而设置的最高和最低开关频率；从[Freq3，FreqMaxSet]内产生一个随机开关频率作为电机控制器下一个控制节拍的随机开关频率。