本发明提供了一种轨道交通系统运营风险点辨识方法。该方法包括：根据轨道交通系统运营过程中组分节点所属的运营结构，对组分节点进行分类；将选取的组分节点sk的累计故障次数与整个辨识系统中所涉及到的组分节点数的平均值比对；计算组分节点sk的关联重要度Fk，并与整个辨识系统中所涉及到的组分节点数的倒数比对；计算组分节点sk的功能重要度并与数值1比对；根据轨道交通系统运营过程中组分节点sk的累计故障次数、关联重要度和融合功能性三个属性的比对结果确定组分节点sk是否为风险点。本发明提出的轨道交通系统运营风险点辨识方法实现了对不同专业专家的经验和实际运营数据综合考虑，对轨道交通所有组分节点进行全面、有效、精确的分析。